RNA–Protein interactions for RNA: YNL050C

YNL050C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL050C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL050C	YNL050C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	MIH1	P23748	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	APN2	P38207	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	SFB3	P38810	929 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	ABF1	P14164	731 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	SPO11	P23179	398 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	PRP28	P23394	588 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	PCL2	P25693	308 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	PHO11	P35842	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	PHO12	P38693	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	COQ11	Q05892	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL050C	YNL050C	RAD18	P10862	487 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	ADY2	P25613	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	PPZ2	P33329	710 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	PIG2	P40187	538 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	SUT2	Q12286	268 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	MAL31	P38156	614 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
YNL050C	YNL050C	GET2	P40056	285 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	IMO32	P53219	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	ATG33	Q06485	197 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	NTG2	Q08214	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	BIT2	P38346	545 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	YEL020C	P39994	560 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	MRK1	P50873	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	ARO10	Q06408	635 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	THI22	Q06490	572 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	HMG1	P12683	1054 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	SFL1	P20134	766 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	NTH1	P32356	751 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	COX18	P53239	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	ARP4	P80428	489 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	KCC4	P25389	1037 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	SEC6	P32844	805 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	YKR075C	P36155	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	MLH3	Q12083	715 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	BNR1	P40450	1375 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	FUB1	P25659	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	MNN4	P36044	1178 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	GMH1	P36125	273 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	MUP3	P38734	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	BFA1	P47113	574 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	USV1	Q12132	391 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	POM34	Q12445	299 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL050C	YNL050C	SEC15	P22224	910 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	KIN82	P25341	720 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	PET127	P32606	800 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	BCS1	P32839	456 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	GUD1	Q07729	489 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	ECM3	Q99252	613 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	SFP1	P32432	683 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	UBS1	P38290	277 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	PAC2	P39937	518 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	AIM14	P53109	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	YNL193W	P53870	558 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	TFB2	Q02939	513 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	DCS2	Q12123	353 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	CTP1	P38152	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	YHR202W	P38887	602 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	MGS1	P40151	587 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	YGR151C	P53287	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	HOF1	Q05080	669 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	EMP70	P32802	667 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	SET3	P36124	751 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	APL3	P38065	1025 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	BEM4	P39011	633 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	ALG12	P53730	551 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	PPN1	Q04119	674 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL050C	YNL050C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.9 ms