RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	SGO1	Q08490	590 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	RRD2	Q12461	358 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	HMG2	P12684	1045 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	MET4	P32389	672 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	RIM4	P38741	713 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	YNR014W	P53719	212 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	TRE1	Q08919	783 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN5	YLR141W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	RTT107	P38850	1070 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	MND1	P53102	219 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	VPS75	P53853	264 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	UME1	Q03010	460 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	YLR287C	Q05881	355 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	YMC2	P38087	329 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	RAD59	Q12223	238 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	PHO86	P46956	311 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.37	■□□□□ 0.05	not detected
RRN5	YLR141W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	YOL098C	Q12496	1037 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	YER152C	P10356	443 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	HER2	Q03557	464 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	KEX2	P13134	814 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	PPZ1	P26570	692 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	RAD55	P38953	406 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	MMM1	P41800	426 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	STR2	P47164	639 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	FMP25	Q08023	583 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	EXO5	P38289	585 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	HXT8	P40886	569 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	ASG7	P46993	209 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	YDR344C	Q05510	147 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	VPS54	Q12071	889 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN5	YLR141W	PEX34	P25584	144 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	CDC27	P38042	758 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	IES1	P43579	692 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	PFD1	P46988	109 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	PUS2	P53167	370 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	SAM3	Q08986	587 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	HMI1	Q12039	706 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	ATG9	Q12142	997 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	JIP3	O13555	125 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	SPO12	P17123	173 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	MIC60	P36112	540 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YKR051W	P36142	418 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YBL036C	P38197	257 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	SFB3	P38810	929 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	FHL1	P39521	936 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YEL075C	P39972	122 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	CCH1	P50077	2039 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	BET2	P20133	325 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	JNM1	P36224	373 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YAP5	P40574	245 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	PML39	Q03760	334 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	ARO80	Q04052	950 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	ISF1	P32488	338 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	GYP6	P32806	458 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YTA12	P40341	825 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	CDC1	P40986	491 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	LSB6	P42951	607 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	GCN5	Q03330	439 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	NBP2	Q12163	236 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	NDJ1	Q12366	352 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	RAM1	P22007	431 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	RAD16	P31244	790 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	MRP4	P32902	394 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	AVT2	P39981	480 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	GUF1	P46943	645 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	HOP2	P53187	214 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	DDC1	Q08949	612 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YPQ1	Q12010	308 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YKL097C	P34245	136 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
RRN5	YLR141W	YBR225W	P38321	900 aa		15.28	■□□□□ 0.04

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