RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640499.1

VEGFA-231, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-231	ENST00000640499	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	PSME4	Q14997	1843 aa		33.32	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	MS4A1	P11836	297 aa		33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	PODN	Q7Z5L7	613 aa		33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	COA1	Q9GZY4	146 aa		33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	SIL1	Q9H173	461 aa		33.31	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	SHTN1	A0MZ66	631 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499		G3V3G9	751 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	PDE8B	O95263	885 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	UBE4A	Q14139	1066 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	CIAO1	O76071	339 aa		33.29	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	EPHX2	P34913	555 aa		33.29	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	CD209	Q9NNX6	404 aa		33.28	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	FBXO3	Q9UK99	471 aa		33.28	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	FGFR2	P21802	821 aa		33.27	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	ATP8B2	P98198	1209 aa		33.27	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	PDE3A	Q14432	1141 aa		33.27	■■■□□ 2.92
VEGFA-231	ENST00000640499	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		33.26	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	POLA2	Q14181	598 aa		33.25	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	SSH3	Q8TE77	659 aa		33.24	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	GML	Q99445	158 aa		33.24	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	MXD3	Q9BW11	206 aa		33.24	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		33.24	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L3	A6NCW0	530 aa		33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L4	A6NCW7	530 aa		33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	IL1R1	P14778	569 aa		33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	GYG1	P46976	350 aa		33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	DACT2	Q5SW24	774 aa		33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	DPF2	Q92785	391 aa		33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		33.22	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF609	O15014	1411 aa		33.21	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	CEP85	Q6P2H3	762 aa		33.21	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.2	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	MICALL2	Q8IY33	904 aa		33.2	■■■□□ 2.91
VEGFA-231	ENST00000640499	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		33.19	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		33.19	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	EGFR	P00533	1210 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	GTF2I	P78347	998 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	FSTL1	Q12841	308 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	LDHD	Q86WU2	507 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		33.18	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		33.17	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		33.17	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	CHADL	Q6NUI6	762 aa		33.16	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	BCAM	P50895	628 aa		33.15	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	TFCP2	Q12800	502 aa		33.15	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		33.15	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		33.15	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	LPIN2	Q92539	896 aa		33.15	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	SASH1	O94885	1247 aa		33.14	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	CERS5	Q8N5B7	392 aa		33.14	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	FBXW7	Q969H0	707 aa		33.14	■■■□□ 2.9
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	ATP2B3	Q16720	1220 aa		33.13	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	JAG2	Q9Y219	1238 aa		33.13	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499		H7C1D1	291 aa		33.12	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		33.11	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC5A1	P13866	664 aa		33.11	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		33.11	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	TIMM10	P62072	90 aa		33.1	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		33.1	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	USP17L8	P0C7I0	530 aa		33.09	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	ADORA1	P30542	326 aa		33.09	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89
VEGFA-231	ENST00000640499	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.09	■■■□□ 2.89

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