RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	FSD2	A1L4K1	749 aa		24.46	■■□□□ 1.51
ME2-216	ENST00000639850	WASHC4	Q2M389	1173 aa		24.46	■■□□□ 1.51
ME2-216	ENST00000639850	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	24.46	■■□□□ 1.51
ME2-216	ENST00000639850	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	24.45	■■□□□ 1.51
ME2-216	ENST00000639850	NECAB1	Q8N987	351 aa		24.45	■■□□□ 1.51
ME2-216	ENST00000639850	LPIN2	Q92539	896 aa		24.45	■■□□□ 1.51
ME2-216	ENST00000639850	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		24.45	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		24.45	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	GJB2	P29033	226 aa		24.45	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	LAMA4	Q16363	1823 aa		24.45	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	SYT1	P21579	422 aa		24.44	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	ST3GAL1	Q11201	340 aa		24.44	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	STX6	O43752	255 aa		24.44	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	CCDC102B	Q68D86	513 aa		24.44	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	FGFR2	P21802	821 aa		24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	RTL9	Q8NET4	1388 aa		24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	APPBP2	Q92624	585 aa		24.43	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	TCHH	Q07283	1943 aa		24.42	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		24.42	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	24.42	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	PHKA1	P46020	1223 aa		24.42	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	NHS	Q6T4R5	1651 aa		24.42	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	24.41	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	SLC5A1	P13866	664 aa		24.41	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	24.41	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	FAM182B	Q5T319	152 aa		24.41	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		24.41	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	24.41	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		24.41	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850		Q6ZUG5	572 aa		24.4	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	24.4	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	24.4	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	24.4	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.5
ME2-216	ENST00000639850	ERFE	Q4G0M1	354 aa		24.39	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	DTNB	O60941	627 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	SCN7A	Q01118	1682 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850		E7EWF7	191 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	FGD1	P98174	961 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	STK3	Q13188	491 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GPT2	Q8TD30	523 aa		24.38	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850		A0A0G2JLW4	131 aa		24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	RGL2	O15211	777 aa		24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	RPS6KA4	O75676	772 aa		24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	ADD2	P35612	726 aa		24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	SMIM5	Q71RC9	77 aa		24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	24.37	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	SNAP23	O00161	211 aa		24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	F13A1	P00488	732 aa		24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	CASZ1	Q86V15	1759 aa		24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	CERK	Q8TCT0	537 aa		24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	NARF	Q9UHQ1	456 aa		24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		24.36	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GPAA1	O43292	621 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	MRE11	P49959	708 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GNPAT	O15228	680 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	FOXP2	O15409	715 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	BRF1	Q92994	677 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	MTMR6	Q9Y217	621 aa		24.35	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	CHRND	Q07001	517 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	SPATA5	Q8NB90	893 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	AFF2	P51816	1311 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	SBF2	Q86WG5	1849 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	MBD3	O95983	291 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	FGA	P02671	866 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	UBE3C	Q15386	1083 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GTF3C6	Q969F1	213 aa		24.34	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	ZPR1	O75312	459 aa		24.33	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	PDC	P20941	246 aa		24.33	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		24.33	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		24.33	■■□□□ 1.49
ME2-216	ENST00000639850	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.48

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