RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-208ENST00000608842 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.14■■■□□ 2.1
DGCR6-208ENST00000608842 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
DGCR6-208ENST00000608842 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 ZNF827Q17R98 1081 aa28.13■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 FBXO41Q8TF61 875 aa28.13■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 AKT1S1Q96B36 256 aa28.13■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.13■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.12■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.11■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.11■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.11■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 CNBD1Q8NA66 436 aa28.11■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.09■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 IL27Q8NEV9 243 aa28.08■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 MAST3O60307 1309 aa28.08■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.08■■■□□ 2.09
DGCR6-208ENST00000608842 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 SLC27A2O14975 620 aa28.07■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 DDR1Q08345 913 aa28.07■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.07■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.07■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 SERPINB2P05120 415 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 TTC14Q96N46 770 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 LAMA4Q16363 1823 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 RASGRF1Q13972 1273 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 UBE4AQ14139 1066 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 OSBP2Q969R2 916 aa28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 M0R2C6 588 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 MCM2P49736 904 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 BCAMP50895 628 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.05■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 SPATA5Q8NB90 893 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 NPHP1O15259 732 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 KCNJ4P48050 445 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.04■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 VPS53Q5VIR6 699 aa28.03■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.03■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 NBR1Q14596 966 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 CRY2Q49AN0 593 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 ADD2P35612 726 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 APPBP2Q92624 585 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 TMX3Q96JJ7 454 aa28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
DGCR6-208ENST00000608842 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 NFKBIBQ15653 356 aa28.01■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 CPA1P15085 419 aa28■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 RNF20Q5VTR2 975 aa28■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 GRAPQ13588 217 aa27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 FOXP2O15409 715 aa27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 ST5P78524 1137 aa27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 GYG1P46976 350 aa27.98■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 CUL4AQ13619 759 aa27.98■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 UBE3CQ15386 1083 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 WASHC4Q2M389 1173 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 RUFY3Q7L099 469 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 IRS2Q9Y4H2 1338 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 CYP21A2P08686 494 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 AK2P54819 239 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.97■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
DGCR6-208ENST00000608842 KLRK1P26718 216 aa27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms