RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548971.5

TARBP2-209, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, humanhuman

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2-209ENST00000548971 SNAP23O00161 211 aa25.24■■□□□ 1.63
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TARBP2-209ENST00000548971 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TARBP2-209ENST00000548971 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.24■■□□□ 1.63
TARBP2-209ENST00000548971 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.24■■□□□ 1.63
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TARBP2-209ENST00000548971 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
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TARBP2-209ENST00000548971 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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TARBP2-209ENST00000548971 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP2-209ENST00000548971 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.22■■□□□ 1.63
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TARBP2-209ENST00000548971 ZNF609O15014 1411 aa25.21■■□□□ 1.63
TARBP2-209ENST00000548971 ECE2O60344 883 aa25.2■■□□□ 1.62
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TARBP2-209ENST00000548971 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP2-209ENST00000548971 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.2■■□□□ 1.62
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TARBP2-209ENST00000548971 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP2-209ENST00000548971 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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TARBP2-209ENST00000548971 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.17■■□□□ 1.62
TARBP2-209ENST00000548971 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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TARBP2-209ENST00000548971 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.15■■□□□ 1.62
TARBP2-209ENST00000548971 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.15■■□□□ 1.62
TARBP2-209ENST00000548971 TNNI3KQ59H18 835 aa25.15■■□□□ 1.62
TARBP2-209ENST00000548971 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.15■■□□□ 1.62
TARBP2-209ENST00000548971 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.14■■□□□ 1.62
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TARBP2-209ENST00000548971 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TARBP2-209ENST00000548971 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.06■■□□□ 1.6
TARBP2-209ENST00000548971 XAGE2Q96GT9 111 aa25.06■■□□□ 1.6
TARBP2-209ENST00000548971 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TARBP2-209ENST00000548971 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.05■■□□□ 1.6
TARBP2-209ENST00000548971 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.05■■□□□ 1.6
TARBP2-209ENST00000548971 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.05■■□□□ 1.6
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