RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
MLH1-222	ENST00000539477	PDE8B	O95263	885 aa		11.52	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	ADORA1	P30542	326 aa		11.52	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	TIMM10	P62072	90 aa		11.52	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.52	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.52	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CENPF	P49454	3210 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	BCAM	P50895	628 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CXCL9	Q07325	125 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477		G3V3G9	751 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	FZD9	O00144	591 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	PSMD14	O00487	310 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF609	O15014	1411 aa		11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477		A0A1B0GUL7	405 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	EYA3	Q99504	573 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CIAO1	O76071	339 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	FGFR2	P21802	821 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	SCN4A	P35499	1836 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	EGFR	P00533	1210 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	PHKA1	P46020	1223 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	SCNN1D	P51172	638 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	GTF2I	P78347	998 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	POTEC	B2RU33	542 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	EPS15	P42566	896 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	GRIK5	Q16478	980 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.46	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	LPIN2	Q92539	896 aa		11.46	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.46	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.46	□□□□□ -0.57
MLH1-222	ENST00000539477	HMMR	O75330	724 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	IGHD	P01880	384 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	SLC5A1	P13866	664 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	SCARF1	Q14162	830 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	GPC2	Q8N158	579 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	AACS	Q86V21	672 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MLH1-222	ENST00000539477	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.44	□□□□□ -0.58

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