RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 CSRNP1Q96S65 589 aa3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 HINFPQ9BQA5 517 aa3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLK14Q9P0G3 267 aa3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC10BA6NIK2 292 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 NLRP12P59046 1061 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 CYP27A1Q02318 531 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 HYAL2Q12891 473 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 COL19A1Q14993 1142 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 NUTM2GQ5VZR2 741 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 WWC1Q8IX03 1113 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 KLHDC7BQ96G42 594 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 ADAM19Q9H013 955 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 GDPD2Q9HCC8 539 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 CYP4F12Q9HCS2 524 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM53CQ9NYF3 392 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 BCS1LQ9Y276 419 aa3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 C21orf2O43822 256 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 EGFRP00533 1210 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTPRAP18433 802 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 CFPP27918 469 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 SCNN1AP37088 669 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 C11orf91Q3C1V1 193 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 OGFOD1Q8N543 542 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 LMCD1Q9NZU5 365 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIAA1024Q9UPX6 916 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP20Q9Y2K6 914 aa3.28□□□□□ -1.88
IGKV1-22-201ENST00000524313 CTSWP56202 376 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ATP11AP98196 1134 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 NEUROD2Q15784 382 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ECM1Q16610 540 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 MLANAQ16655 118 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 NFXL1Q6ZNB6 911 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZAR1Q86SH2 424 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 PI4K2BQ8TCG2 481 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC7A3Q8WY07 619 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 COL26A1Q96A83 441 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.27□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 H3BRJ5 948 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ADAM11O75078 769 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEC13P55735 322 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 PIP4K2BP78356 416 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLDN10P78369 228 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 NLRP13Q86W25 1043 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 FBLIM1Q8WUP2 373 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 WNT8BQ93098 351 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 JAG2Q9Y219 1238 aa3.26□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 MEGF11A6BM72 1044 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP17L3A6NCW0 530 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP17L4A6NCW7 530 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM170BA6NMN3 283 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 EPHA1P21709 976 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP17L2Q6R6M4 530 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP17L1Q7RTZ2 530 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 NCAPG2Q86XI2 1143 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 SIX5Q8N196 739 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 MISP3Q96FF7 219 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 RASSF4Q9H2L5 321 aa3.25□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 NFIBO00712 420 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 TSPAN15O95858 294 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 INHBBP09529 407 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGFBP4P22692 258 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ADMP35318 185 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAP7Q14244 749 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 KCNMB1Q16558 191 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 TREML1Q86YW5 311 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 SHISA5Q8N114 240 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP26Q9BXU7 913 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa3.24□□□□□ -1.89
IGKV1-22-201ENST00000524313 UBAP1LF5GYI3 381 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms