RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520924.5

TPT1-AS1-212, TPT1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPT1-AS1, Length 553 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPT1-AS1-212ENST00000520924 GGA1Q9UJY5 639 aa10.29□□□□□ -0.76
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TPT1-AS1-212ENST00000520924 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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TPT1-AS1-212ENST00000520924 USP17L4A6NCW7 530 aa10.28□□□□□ -0.76
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TPT1-AS1-212ENST00000520924 SLC4A2P04920 1241 aa10.2□□□□□ -0.78
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TPT1-AS1-212ENST00000520924 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.2□□□□□ -0.78
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TPT1-AS1-212ENST00000520924 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 LRCH3Q96II8 777 aa10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 CENPFP49454 3210 aa10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 HTTP42858 3142 aa10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.18□□□□□ -0.78
TPT1-AS1-212ENST00000520924 SCN9AQ15858 1988 aa10.18□□□□□ -0.78
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