RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499326.1

GABPB1-AS1-201, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 717 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DPF2Q92785 391 aa10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.55□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PSMD14O00487 310 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NUDT7P0C024 238 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MYL6BP14649 208 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HDAC9Q9UKV0 1011 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.54□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TBC1D8O95759 1140 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PLCB2Q00722 1185 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MFSD10Q14728 455 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PARP10Q53GL7 1025 aa10.52□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CDCA5Q96FF9 252 aa10.52□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.52□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.52□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TBC1D12O60347 775 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GRAPQ13588 217 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 WASHC4Q2M389 1173 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SULF1Q8IWU6 871 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 WDR70Q9NW82 654 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GGA3Q9NZ52 723 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RTL9Q8NET4 1388 aa10.51□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 RUNDC1Q96C34 613 aa10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.5□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LAMB2P55268 1798 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GPR25O00155 361 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ECE2O60344 883 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MOB2Q70IA6 237 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TAF1P21675 1872 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 HTTP42858 3142 aa10.49□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NEFMP07197 916 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TM4SF4P48230 202 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FKBP1BP68106 108 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NFE2L2Q16236 605 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 POLLQ9UGP5 575 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 BRCA2P51587 3418 aa10.48□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 LRRC37AA6NMS7 1700 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CENPFP49454 3210 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 C6orf229H3BNL8 230 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMPOP42166 694 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 GPSM2P81274 684 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SCARF1Q14162 830 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PDIA6Q15084 440 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TMC4Q7Z404 712 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 NLRP10Q86W26 655 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.47□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 FKTNO75072 461 aa10.46□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 PROSER3Q2NL68 480 aa10.46□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
GABPB1-AS1-201ENST00000499326 ERBB4Q15303 1308 aa10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms