RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 CRBNQ96SW2 442 aa40.84■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 GPC2Q8N158 579 aa40.83■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 RAD17O75943 681 aa40.82■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 CEP126Q9P2H0 1117 aa40.82■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 COA1Q9GZY4 146 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 NMRK2Q9NPI5 230 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 KCNQ5Q9NR82 932 aa40.81■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 FGFR2P21802 821 aa40.8■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 CIAPIN1Q6FI81 312 aa40.8■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 PODNQ7Z5L7 613 aa40.8■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 SIRT2Q8IXJ6 389 aa40.8■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 GJA3Q9Y6H8 435 aa40.8■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 SURF6O75683 361 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 TNIP1Q15025 636 aa40.76■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
CHKB-210ENST00000484266 RRAGCQ9HB90 399 aa40.76■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 CD209Q9NNX6 404 aa40.76■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 SCN4AP35499 1836 aa40.75■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 POTECB2RU33 542 aa40.75■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 TFCP2Q12800 502 aa40.75■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 ZNF804AQ7Z570 1209 aa40.75■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 PSMD14O00487 310 aa40.74■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 LPIN2Q92539 896 aa40.74■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 ARAP2Q8WZ64 1704 aa40.73■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 HMMRO75330 724 aa40.73■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 SASH1O94885 1247 aa40.73■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 GYG1P46976 350 aa40.73■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 ATP2B3Q16720 1220 aa40.73■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 SLC5A1P13866 664 aa40.72■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CHKB-210ENST00000484266 KIF3CO14782 793 aa40.69■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 IL1R1P14778 569 aa40.69■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 FBXO33Q7Z6M2 555 aa40.69■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 VIL1P09327 827 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 SCNN1DP51172 638 aa40.68■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa40.68■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 USP17L3A6NCW0 530 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 USP17L4A6NCW7 530 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 USP17L1Q7RTZ2 530 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 CAVIN4Q5BKX8 364 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 AKAP2Q9Y2D5 859 aa40.67■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa40.66■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 ZNF609O15014 1411 aa40.65■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 IQCA1LA6NCM1 817 aa40.65■■■■■ 4.1
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CHKB-210ENST00000484266 BCAMP50895 628 aa40.64■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 STRIP1Q5VSL9 837 aa40.64■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 VPS37DQ86XT2 251 aa40.64■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 HACL1Q9UJ83 578 aa40.64■■■■■ 4.1
CHKB-210ENST00000484266 TIMM10P62072 90 aa40.63■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 DACT2Q5SW24 774 aa40.63■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 GPRC5DQ9NZD1 345 aa40.63■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 GTF2IP78347 998 aa40.62■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 TTLL5Q6EMB2 1281 aa40.62■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 FBXW7Q969H0 707 aa40.62■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 RPS12P25398 132 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
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CHKB-210ENST00000484266 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa40.61■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 EXOC6Q8TAG9 804 aa40.61■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 MYH13Q9UKX3 1938 aa40.61■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 DPF2Q92785 391 aa40.6■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 GPR108Q9NPR9 543 aa40.6■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 EPS15P42566 896 aa40.59■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 AAMPQ13685 434 aa40.59■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 ERC1Q8IUD2 1116 aa40.59■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 MXD3Q9BW11 206 aa40.59■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
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CHKB-210ENST00000484266 TNNI3KQ59H18 835 aa40.58■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 AGBL3Q8NEM8 1001 aa40.58■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 XAGE2Q96GT9 111 aa40.58■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 GMLQ99445 158 aa40.58■■■■■ 4.09
CHKB-210ENST00000484266 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa40.58■■■■■ 4.09
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CHKB-210ENST00000484266 FAM205AQ6ZU69 1335 aa40.56■■■■■ 4.08
CHKB-210ENST00000484266 SHTN1A0MZ66 631 aa40.56■■■■■ 4.08
CHKB-210ENST00000484266 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
CHKB-210ENST00000484266 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
CHKB-210ENST00000484266 JAG2Q9Y219 1238 aa40.55■■■■■ 4.08
CHKB-210ENST00000484266 MYO3BQ8WXR4 1341 aa40.54■■■■■ 4.08
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CHKB-210ENST00000484266 MICALL2Q8IY33 904 aa40.54■■■■■ 4.08
CHKB-210ENST00000484266 RHPN1Q8TCX5 695 aa40.54■■■■■ 4.08
CHKB-210ENST00000484266 CCDC102BQ68D86 513 aa40.53■■■■■ 4.08
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