RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 EPHA1P21709 976 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CES1P23141 567 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTMR3Q13615 1198 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMEPA1Q969W9 287 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 POLIQ9UNA4 740 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BRJ5 948 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FSCN2O14926 492 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACPPP15309 386 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 EHHADHQ08426 723 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C8orf34Q49A92 452 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARTNQ5T4W7 220 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC16Q8NEE8 873 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 WNT8BQ93098 351 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM177BA6PVY3 158 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FZD6O60353 706 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 WISP1O95388 367 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP5P45974 858 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRP8Q14114 963 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACAD11Q709F0 780 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CARNS1A5YM72 827 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNFRSF21O75509 655 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLB1P16278 677 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CABP4P57796 275 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIP4K2BP78356 416 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 UVSSAQ2YD98 709 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC51AQ86UW1 340 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 GJD3Q8N144 294 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CEP41Q9BYV8 373 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEC31BQ9NQW1 1179 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SOX13Q9UN79 622 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 EREGO14944 169 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAM11O75078 769 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHACTR2O75167 634 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 EDN3P14138 238 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDC25BP30305 580 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 HHIPQ96QV1 700 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF112Q9ULX5 631 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABL1P00519 1130 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FSTP19883 344 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 AAMPQ13685 434 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 DUOXA2Q1HG44 320 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OSMRQ99650 979 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAXQ9Y2V3 346 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ICMTO60725 284 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRPA1O75762 1119 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 BSNDQ8WZ55 320 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 NXPE3Q969Y0 559 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 GSC2O15499 205 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERPINB4P48594 390 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARL4DP49703 201 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYRFLQ96LU7 910 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF208Q9H0X6 261 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BRB1 525 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGLV1-40P01703 118 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 NLRP12P59046 1061 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms