RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 NID1P14543 1247 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ATP11AP98196 1134 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCNJLQ8IV13 435 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 OSMRQ99650 979 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADAM19Q9H013 955 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ACPPP15309 386 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTPRAP18433 802 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ITGAEP38570 1179 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 PODNQ7Z5L7 613 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 NXPE3Q969Y0 559 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 TCF12Q99081 682 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 MUC3BQ9H195 1237 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ITPKAP23677 461 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 GNA15P30679 374 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 CEP135Q66GS9 1140 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SOX13Q9UN79 622 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPG7Q9UQ90 795 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 IRS1P35568 1242 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 BAG6P46379 1132 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 GRM2Q14416 872 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 MSL1Q68DK7 614 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUDT8Q8WV74 236 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 BSNDQ8WZ55 320 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 WNT8BQ93098 351 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 HHIPQ96QV1 700 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SETDB2Q96T68 719 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 EHD4Q9H223 541 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 RRAGCQ9HB90 399 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ABCB6Q9NP58 842 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 CDC27P30260 824 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 DAB2P98082 770 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMC4Q7Z404 712 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 GIPC2Q8TF65 315 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM11Q96F44 468 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 C12orf49Q9H741 205 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 H3BRJ5 948 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 PI16Q6UXB8 463 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCO2Q9BYV7 579 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCL11AQ9H165 835 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 A0A096LPE4 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 A0A1W2PPZ6 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM177BA6PVY3 158 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 VAMP1P23763 118 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 GSTT1P30711 240 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 GRIA4P48058 902 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 PIP4K2BP78356 416 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF576Q9H609 170 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 PARP2Q9UGN5 583 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPME1Q9Y570 386 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-641P-201ENST00000384006 AK5Q9Y6K8 562 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms