RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.27□□□□□ -0.92
PKHD1-201ENST00000340994 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.27□□□□□ -0.92
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PKHD1-201ENST00000340994 ATP2B2Q01814 1243 aa9.27□□□□□ -0.93
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PKHD1-201ENST00000340994 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R7Q15435 360 aa9.27□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.27□□□□□ -0.93
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PKHD1-201ENST00000340994 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1-201ENST00000340994 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1-201ENST00000340994 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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PKHD1-201ENST00000340994 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.25□□□□□ -0.93
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PKHD1-201ENST00000340994 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.25□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 TMX1Q9H3N1 280 aa9.25□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.25□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.25□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.25□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 DENND2CQ68D51 928 aa9.25□□□□□ -0.93
PKHD1-201ENST00000340994 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.25□□□□□ -0.93
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