RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.58■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 GREM2Q9H772 168 aa24.58■■□□□ 1.53
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KCNQ1-202ENST00000335475 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
KCNQ1-202ENST00000335475 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.57■■□□□ 1.52
KCNQ1-202ENST00000335475 ITGA6P23229 1130 aa24.57■■□□□ 1.52
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KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.49■■□□□ 1.51
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.49■■□□□ 1.51
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KCNQ1-202ENST00000335475 H3BQV1 296 aa24.46■■□□□ 1.51
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KCNQ1-202ENST00000335475 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
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KCNQ1-202ENST00000335475 HAND2P61296 217 aa24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1-202ENST00000335475 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.45■■□□□ 1.5
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KCNQ1-202ENST00000335475 FGFR2P21802 821 aa24.44■■□□□ 1.5
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