RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 SUSD4Q5VX71 490 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 RFX7Q2KHR2 1363 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF609O15014 1411 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 TULP2O00295 520 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 KLHL40Q2TBA0 621 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 IL17RAQ96F46 866 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 OGFRQ9NZT2 677 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 NARFQ9UHQ1 456 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 AKAP2Q9Y2D5 859 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXA3-201ENST00000317201 C4BP0C0L5 1744 aa17.46■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 NTSR2O95665 410 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.386e-10■■□□□ 13.4
HOXA3-201ENST00000317201 DDIT3P35638 169 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC24Q50LG9 513 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 CEP126Q9P2H0 1117 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 ITGA6P23229 1130 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RABEP1Q15276 862 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 FAM182BQ5T319 152 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 MCTP1Q6DN14 999 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 SGSM2O43147 1006 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 SYNE4Q8N205 404 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 ANAPC15P60006 121 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 SLC27A3Q5K4L6 730 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 GREM2Q9H772 168 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 SNRKQ9NRH2 765 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 SPEF2Q9C093 1822 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 MCCP23508 829 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 TERF2Q15554 542 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC12Q96J65 1359 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RAD50Q92878 1312 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF445P59923 1031 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 HAUS7Q99871 368 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RSPH14Q9UHP6 348 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 ADRA2BP18089 450 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 DBNDD2Q9BQY9 259 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 GNPATO15228 680 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC152Q4G0S7 254 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 FEZ1Q99689 392 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1B0GUL7 405 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 BAG4O95429 457 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 SLC10A5Q5PT55 438 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 NYXQ9GZU5 481 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 TOMM22Q9NS69 142 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 ANO2Q9NQ90 1003 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA3-201ENST00000317201 MROH5Q6ZUA9 1318 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 C4AP0C0L4 1744 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 SYCE3A1L190 88 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 ZPR1O75312 459 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 KCNQ4P56696 695 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD7Q92527 254 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 VGLL2Q8N8G2 317 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 BANK1Q8NDB2 785 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 NEUROD6Q96NK8 337 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 PTMSP20962 102 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 GPATCH11Q8N954 259 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 HSPA4P34932 840 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 TIMM10P62072 90 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 USPL1Q5W0Q7 1092 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 ST7Q9NRC1 585 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 CNNM1Q9NRU3 951 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 GYS2P54840 703 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 METTL24Q5JXM2 366 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC158Q5M9N0 1113 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXA3-201ENST00000317201 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms