RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 PRPHP41219 470 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 USP48Q86UV5 1035 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 IFT81Q8WYA0 676 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 SYT1P21579 422 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 UBXN1Q04323 297 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 SNX16P57768 344 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 WDR97A6NE52 1622 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 RASA3Q14644 834 aa23.18■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 HECW1Q76N89 1606 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 UVSSAQ2YD98 709 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 CTAGE9A4FU28 777 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 NLRP3Q96P20 1036 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 ARAP1Q96P48 1450 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 ZMYND15Q9H091 742 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 PPP1R7Q15435 360 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 TMTC2Q8N394 836 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 BMP15O95972 392 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 COPS6Q7L5N1 327 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 NEK11Q8NG66 645 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 IGHDP01880 384 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 KRT2P35908 639 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 KRT79Q5XKE5 535 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 RTL1A6NKG5 1358 aa23.16■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 TLDC2A0PJX2 215 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 SDSP20132 328 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 RXRAP19793 462 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 SIRT1Q96EB6 747 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 BACH1O14867 736 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 CFAP157Q5JU67 520 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 GNAQP50148 359 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 KRT5P13647 590 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.14■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.14■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 OPA1O60313 960 aa23.14■■□□□ 1.3
ZBED3-201ENST00000255198 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 TRAF1Q13077 416 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 DACT1Q9NYF0 836 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 MEIS3Q99687 375 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 KIF5AQ12840 1032 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 CEP83Q9Y592 693 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 C8orf37Q96NL8 207 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC42Q96M95 316 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 SPAG1Q07617 926 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM75PA6NK02 468 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 ZEB2O60315 1214 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 KRT9P35527 623 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC121Q6ZUS5 278 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED3-201ENST00000255198 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms