RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CNGA4Q8IV77 575 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF521Q96K83 1311 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PLA2G4AP47712 749 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PACS2Q86VP3 889 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 IFT88Q13099 833 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 GBP5Q96PP8 586 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CDC23Q9UJX2 597 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CUL4AQ13619 759 aa14.58□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TTC36A6NLP5 189 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 RGS12O14924 1447 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TACC1O75410 805 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 COG3Q96JB2 828 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 EPS15P42566 896 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.58□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 MAP3K9P80192 1104 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 KANK3Q6NY19 840 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 KLC4Q9NSK0 619 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ABCB6Q9NP58 842 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SARM1Q6SZW1 724 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 BRF1Q92994 677 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NLRP12P59046 1061 aa14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 USP27XA6NNY8 438 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 N4BP3O15049 544 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC160A6NGH7 325 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DAAM2Q86T65 1068 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 VCX3BQ9H321 246 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 MAP7Q14244 749 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.56□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ERICH2A1L162 156 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 RUFY3Q7L099 469 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 IFT81Q8WYA0 676 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 HIP1RO75146 1068 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NR1I2O75469 434 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SPAG5Q96R06 1193 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 AACSQ86V21 672 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ETAA1Q9NY74 926 aa14.55□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CLTAP09496 248 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ABCC5O15440 1437 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DESP17661 470 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ATP1A2P50993 1020 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 APBA1Q02410 837 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 IFT20Q8IY31 132 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TTC14Q96N46 770 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 EVI5LQ96CN4 794 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 MTMR6Q9Y217 621 aa14.54□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CETN3O15182 167 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 KIF5AQ12840 1032 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 MTX1Q13505 466 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms