RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Phactr2B1AVP0 632 aa29.24■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prom2Q3UUY6 835 aa29.24■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sept9Q80UG5 583 aa29.24■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Golgb1E9PVZ8 3238 aa29.24■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Psd3Q2PFD7 1037 aa29.24■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kank4Q6P9J5 1016 aa29.24■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nme8Q715T0 586 aa29.23■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ube3cQ80U95 1083 aa29.23■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mre11Q61216 706 aa29.22■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa29.22■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ltn1Q6A009 1767 aa29.22■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp6v0a2P15920 856 aa29.22■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 RubcnlQ3TD16 648 aa29.22■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pla2g4fQ50L41 855 aa29.22■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lrrfip2Q91WK0 415 aa29.22■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kcnb2A6H8H5 907 aa29.21■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa29.21■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa29.21■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ankrd63A2ARS0 390 aa29.21■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gja5Q01231 358 aa29.2■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa29.2■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cyp2d9P11714 504 aa29.2■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wdhd1P59328 1117 aa29.2■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc14a2Q8R4T9 930 aa29.2■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Appbp2Q9DAX9 585 aa29.2■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nup188Q6ZQH8 1759 aa29.2■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 EvcP57680 1005 aa29.19■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sgsm2Q80U12 1005 aa29.18■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Polr3dQ91WD1 398 aa29.18■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Chmp4cQ9D7F7 232 aa29.18■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gjb2Q00977 226 aa29.17■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdca7lQ922M5 438 aa29.17■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slfn1Q9Z0I7 337 aa29.17■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pcsk7Q61139 770 aa29.16■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 AidaQ8C4Q6 305 aa29.16■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 FliiQ9JJ28 1271 aa29.15■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa29.14■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Usp44Q8C2S0 711 aa29.14■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa29.14■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Izumo3A6PWV3 263 aa29.14■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc7Q9D541 371 aa29.14■■■□□ 2.26
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myh13B1AR69 1938 aa29.14■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prl7a2O54831 253 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tti2Q8BGV4 512 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sp8Q8BMJ8 486 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kcnq3Q8K3F6 873 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atf7Q8R0S1 413 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Vwa3bJ9JI28 736 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sytl4Q9R0Q1 673 aa29.13■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Bend4P86174 541 aa29.12■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dok7Q18PE0 504 aa29.12■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ell2Q3UKU1 639 aa29.12■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 UvssaQ9D479 717 aa29.12■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 IcoslgQ9JHJ8 322 aa29.12■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 F2rP30558 430 aa29.11■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rnf20Q5DTM8 973 aa29.11■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lmod1Q8BVA4 595 aa29.11■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hmg20bQ9Z104 317 aa29.11■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc51aQ8R000 340 aa29.1■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mapkapk5O54992 473 aa29.1■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Shisa4Q8CA71 197 aa29.1■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Krt24A1L317 512 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stat5bP42232 786 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Siah1aP61092 282 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc7a3P70423 618 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm5592Q3V0A6 857 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 SnrkQ8VDU5 748 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam83bQ0VBM2 1012 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q8C6G1 249 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tceanc2Q8R2M0 207 aa29.09■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sik3Q6P4S6 1311 aa29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A1W2P7S8 802 aa29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ercc3P49135 783 aa29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc51Q3URS9 406 aa29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 ErfeQ6PGN1 340 aa29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rufy3Q9D394 469 aa29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Letm1Q9Z2I0 738 aa29.08■■■□□ 2.25
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prl7d1P04769 244 aa29.06■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa29.06■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Washc4Q3UMB9 1173 aa29.06■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 FAM186AQ9D9R9 1790 aa29.06■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tuft1O08970 390 aa29.05■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fchsd1Q6PFY1 688 aa29.05■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rassf8Q8CJ96 419 aa29.05■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q9D9S1 216 aa29.05■■■□□ 2.24
Odc1-201ENSMUST00000171737 KinQ8K339 391 aa29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms