RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000094245.3

Cldn3-201, Transcript of Claudin-3, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Cldn3, Length 1,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ftl2P49945 183 aa23.22■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tlr7P58681 1050 aa23.22■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Akap4Q60662 849 aa23.22■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mum1Q6DID5 682 aa23.22■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pxylp1Q8BHA9 480 aa23.21■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc44a4Q91VA1 707 aa23.21■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znf330Q922H9 316 aa23.21■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sall2Q9QX96 1004 aa23.21■■□□□ 1.31
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Brpf1B2RRD7 1212 aa23.2■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slain1Q68FF7 579 aa23.2■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sirt2Q8VDQ8 389 aa23.2■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Polr3dQ91WD1 398 aa23.2■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Znf697Q569E7 569 aa23.19■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mkrn1Q9QXP6 481 aa23.19■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rhbdl3P58873 404 aa23.18■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa23.18■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nutm1Q8BHP2 1126 aa23.18■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tgm5Q9D7I9 724 aa23.18■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 AppP12023 770 aa23.17■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Plekhf1Q3TB82 279 aa23.17■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Plbd2Q3TCN2 594 aa23.17■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zkscan8Q8BSL0 588 aa23.16■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mansc4Q3UU94 337 aa23.15■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tgfb1i1Q62219 461 aa23.15■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Epc2Q8C0I4 808 aa23.15■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trmt44Q9D2Q2 713 aa23.15■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tmem79Q9D709 391 aa23.15■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 LratQ9JI60 231 aa23.15■■□□□ 1.3
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa23.14■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Pde8bE9Q4S1 865 aa23.14■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa23.14■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 EhhadhQ9DBM2 718 aa23.14■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Scn10aQ6QIY3 1958 aa23.14■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Myo1bP46735 1107 aa23.13■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc10a5Q5PT54 434 aa23.13■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Dhx38Q80X98 1228 aa23.13■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Q8C5K5 320 aa23.13■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ripk4Q9ERK0 786 aa23.13■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa23.13■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Mast3Q3U214 1321 aa23.12■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sik3Q6P4S6 1311 aa23.12■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Spata18Q0P557 537 aa23.12■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sez6lQ6P1D5 963 aa23.12■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rnf181Q9CY62 165 aa23.12■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fgl2P12804 432 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Traf5P70191 558 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Gm5592Q3V0A6 857 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ofd1Q80Z25 1017 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Snap47Q8R570 413 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 B3galt4Q9Z0F0 371 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tanc1Q0VGY8 1856 aa23.11■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Speer4dL7N216 212 aa23.1■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Eya2O08575 532 aa23.1■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 MycnP03966 462 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fam83bQ0VBM2 1012 aa23.1■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Foxd1Q61345 456 aa23.1■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tceal9Q9DD24 104 aa23.1■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Letm1Q9Z2I0 738 aa23.1■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Usp17ldG5E8G2 545 aa23.09■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Usp17lcG5E8I7 545 aa23.09■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Prkg1P0C605 671 aa23.09■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sult6b1P0CC03 303 aa23.09■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Atp8a2P98200 1148 aa23.09■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Myh15E9Q264 1925 aa23.08■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Itgb7P26011 806 aa23.08■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Spg7Q3ULF4 781 aa23.08■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Zbtb3Q91X45 518 aa23.08■■□□□ 1.29
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Skint7A7XV04 395 aa23.07■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Npr3P70180 536 aa23.07■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Bcs1lQ9CZP5 418 aa23.07■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Myh4Q5SX39 1939 aa23.06■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ankrd63A2ARS0 390 aa23.06■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Atg9aQ68FE2 551 aa23.06■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Adam39Q7M762 756 aa23.06■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Sept9Q80UG5 583 aa23.06■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Phf23Q8BSN5 401 aa23.06■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ankrd44B2RXR6 993 aa23.05■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Podnl1Q6P3Y9 559 aa23.05■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tmem87bQ8BKU8 555 aa23.05■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Fbxo3Q9DC63 480 aa23.05■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 S1pr4Q9Z0L1 386 aa23.05■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Col11a1Q61245 1804 aa23.04■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa23.04■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Trpv1Q704Y3 839 aa23.04■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Ciao1Q99KN2 339 aa23.04■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Stag1Q9D3E6 1258 aa23.04■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa23.04■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 UncxO08934 530 aa23.03■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 Psen2Q61144 448 aa23.03■■□□□ 1.28
Cldn3-201ENSMUST00000094245 CrkQ64010 304 aa23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55 ms