Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.31■■■■■ 5
Itgb7P26011 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Itgb7P26011 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Itgb7P26011 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Itgb7P26011 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Itgb7P26011 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Itgb7P26011 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Itgb7P26011 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Itgb7P26011 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Itgb7P26011 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Itgb7P26011 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Itgb7P26011 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Itgb7P26011 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Itgb7P26011 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Itgb7P26011 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Itgb7P26011 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Itgb7P26011 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Itgb7P26011 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Itgb7P26011 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Itgb7P26011 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Itgb7P26011 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Itgb7P26011 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Itgb7P26011 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Itgb7P26011 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Itgb7P26011 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Itgb7P26011 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Itgb7P26011 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Itgb7P26011 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Itgb7P26011 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Itgb7P26011 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Itgb7P26011 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Itgb7P26011 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Itgb7P26011 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Itgb7P26011 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Itgb7P26011 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Itgb7P26011 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Itgb7P26011 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Itgb7P26011 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Itgb7P26011 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Itgb7P26011 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Itgb7P26011 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Itgb7P26011 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Itgb7P26011 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Itgb7P26011 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Itgb7P26011 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Itgb7P26011 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Itgb7P26011 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Itgb7P26011 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Itgb7P26011 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Itgb7P26011 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Itgb7P26011 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Itgb7P26011 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Itgb7P26011 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Itgb7P26011 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Itgb7P26011 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Itgb7P26011 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Itgb7P26011 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Itgb7P26011 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Itgb7P26011 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Itgb7P26011 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Itgb7P26011 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Itgb7P26011 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Itgb7P26011 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Itgb7P26011 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Itgb7P26011 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Itgb7P26011 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Itgb7P26011 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Itgb7P26011 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Itgb7P26011 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Itgb7P26011 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Itgb7P26011 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Itgb7P26011 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Itgb7P26011 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Itgb7P26011 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Itgb7P26011 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Itgb7P26011 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Itgb7P26011 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Itgb7P26011 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Itgb7P26011 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Itgb7P26011 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Itgb7P26011 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Itgb7P26011 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Itgb7P26011 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Itgb7P26011 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Itgb7P26011 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Itgb7P26011 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Itgb7P26011 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Itgb7P26011 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Itgb7P26011 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Itgb7P26011 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Itgb7P26011 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Itgb7P26011 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Itgb7P26011 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Itgb7P26011 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Itgb7P26011 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Itgb7P26011 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Itgb7P26011 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Itgb7P26011 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Itgb7P26011 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Itgb7P26011 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms