RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020552.6

Tpgs1-201, Transcript of Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tpgs1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rhbdl3P58873 404 aa22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Atp8a2P98200 1148 aa22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Mxd3Q80US8 206 aa22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Lman1lQ8VCD3 505 aa22.25■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Speer4dL7N216 212 aa22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sult6b1P0CC03 303 aa22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 LdhdQ7TNG8 484 aa22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tmem87bQ8BKU8 555 aa22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Kbtbd13Q8C828 458 aa22.24■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slc44a4Q91VA1 707 aa22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Phf23Q8BSN5 401 aa22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Trmt44Q9D2Q2 713 aa22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ripk3Q9QZL0 486 aa22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Stk36Q69ZM6 1316 aa22.22■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ankrd44B2RXR6 993 aa22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Wnt10bP48614 389 aa22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Adamts19P59509 1210 aa22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ripk4Q9ERK0 786 aa22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 SisF8VQM5 1818 aa22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Fbxo3Q9DC63 480 aa22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Peak1Q69Z38 1735 aa22.2■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Irf6P97431 467 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Spg7Q3ULF4 781 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gm5592Q3V0A6 857 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Atg9aQ68FE2 551 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ciao1Q99KN2 339 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Rgs19Q9CX84 216 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Letm1Q9Z2I0 738 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Mast3Q3U214 1321 aa22.19■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 HunkO88866 714 aa22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ttll12Q3UDE2 639 aa22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Akap4Q60662 849 aa22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Foxn1Q61575 648 aa22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tll1Q62381 1013 aa22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tgm5Q9D7I9 724 aa22.18■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Prkar2bP31324 416 aa22.17■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ankrd63A2ARS0 390 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Spata18Q0P557 537 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Fam83bQ0VBM2 1012 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Atp2b3Q0VF55 1220 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slc10a5Q5PT54 434 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Kiaa0753Q6A000 959 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Prg3Q9JL95 222 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Myh15E9Q264 1925 aa22.16■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Gm4340L7N2C4 268 aa22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ccdc142Q8CAI1 738 aa22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 MvpQ9EQK5 861 aa22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ier5O89113 308 aa22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Myo1bP46735 1107 aa22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Evi5P97366 809 aa22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 OsbpQ3B7Z2 805 aa22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cwc27Q3TKY6 469 aa22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa22.14■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sez6lQ6P1D5 963 aa22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sept9Q80UG5 583 aa22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cog5Q8C0L8 829 aa22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tmc2Q8R4P4 888 aa22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Myh4Q5SX39 1939 aa22.13■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Prpmp5E9PXN1 296 aa22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Znf697Q569E7 569 aa22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Epc2Q8C0I4 808 aa22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Stag1Q9D3E6 1258 aa22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Tmem79Q9D709 391 aa22.12■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sik3Q6P4S6 1311 aa22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 A0A1W2P7S8 802 aa22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 LtbrP50284 415 aa22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Npr3P70180 536 aa22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Slain1Q68FF7 579 aa22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Pxylp1Q8BHA9 480 aa22.11■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ets1P27577 440 aa22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Triml2E9PW10 424 aa22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Mapkapk5O54992 473 aa22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Sept1P42209 366 aa22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Aldh1l2Q8K009 923 aa22.09■■□□□ 1.13
Tpgs1-201ENSMUST00000020552 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.8 ms