RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261980.2

VSX2-201, Transcript of visual system homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX2, Length 2,995 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2-201ENST00000261980 KLF15Q9UIH9 416 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 MED12Q93074 2177 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SOCS1O15524 211 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 MYOGP15173 224 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 UBE2KP61086 200 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PKIAP61925 76 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 RNF4P78317 190 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 BIKQ13323 160 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 CEBPEQ15744 281 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 COMMD2Q86X83 199 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 OTOSQ8NHW6 89 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 RAB39BQ96DA2 213 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.7□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 IFNL4K9M1U5 179 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 CST4P01036 141 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 CTSBP07858 339 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 TRGC1P0CF51 173 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 IL2RGP31785 369 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ARFRP1Q13795 201 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 DHCR24Q15392 516 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 AWAT2Q6E213 333 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 EXD3Q8N9H8 876 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 FRZBQ92765 325 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ASB16Q96NS5 453 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 OR5B2Q96R09 309 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PLXNA2O75051 1894 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 COL4A6Q14031 1691 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PRNPP04156 253 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PRPS1P60891 318 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 FHL5Q5TD97 284 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 AQP3Q92482 292 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 FOXQ1Q9C009 403 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 STARD10Q9Y365 291 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 LRP12Q9Y561 859 aa14.69□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 CLDN4O14493 209 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 OMGP23515 440 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 P2RY2P41231 377 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SLC6A9P48067 706 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 UBE2V2Q15819 145 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SLC39A7Q92504 469 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SFT2D2O95562 160 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 NUDT14O95848 222 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 RENP00797 406 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PGA4P0DJD7 388 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 PGA5P0DJD9 388 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 EMP2P54851 167 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 C2orf50Q96LR7 162 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 POLE3Q9NRF9 147 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 H3BQ15 152 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 XKRYO14609 159 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 HCKP08631 526 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 VSIG8P0DPA2 414 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 SLC2A1P11166 492 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 HPGDP15428 266 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 S1PR1P21453 382 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 HOGA1Q86XE5 327 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 MUCL1Q96DR8 90 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 OR8B4Q96RC9 309 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 NEU1Q99519 415 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 A6NNC1 897 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 THEGLP0DJG4 465 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 OR3A2P47893 321 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 NHLH2Q02577 135 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 CD226Q15762 336 aa14.67□□□□□ -0.06
VSX2-201ENST00000261980 ZNF74Q16587 644 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms