RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	FAM3A	P98173	230 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	OR10A2	Q9H208	303 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TBX1	O43435	398 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	IFNA2	P01563	188 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ALPL	P05186	524 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	DCTD	P32321	178 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	THBS2	P35442	1172 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PMEL	P40967	661 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MMP16	P51512	607 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	RAD23A	P54725	363 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	BTG1	P62324	171 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ROM1	Q03395	351 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	CR1L	Q2VPA4	569 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	OR51F2	Q8NH61	342 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821		Q8TCH9	128 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MNT	Q99583	582 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821		E9PQ18	207 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PLPP2	O43688	288 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF254	O75437	659 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	SBK2	P0C263	348 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	HNF1A	P20823	631 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	CA6	P23280	308 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	HCCS	P53701	268 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	OR8G1	Q15617	311 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TIGD6	Q17RP2	521 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	FAM57B	Q71RH2	274 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	KRT77	Q7Z794	578 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	GID4	Q8IVV7	300 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	GAL3ST1	Q99999	423 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MRO	Q9BYG7	248 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	LRP12	Q9Y561	859 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ISPD	A4D126	451 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	LRRC30	A6NM36	301 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PPIAL4D	F5H284	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MZT1	Q08AG7	82 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TMED1	Q13445	227 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	SNCB	Q16143	134 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	PGAM5	Q96HS1	289 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM165	Q9HC07	324 aa		11.74	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms