RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ALDOBP05062 364 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 CSF1P09603 554 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS3P35030 304 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 CLN3Q13286 438 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 RAB35Q15286 201 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 GSG1Q2KHT4 349 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 NAA40Q86UY6 237 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 OR5AS1Q8N127 324 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 GPX8Q8TED1 209 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD3Q8WU67 409 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PGAM5Q96HS1 289 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 BEX2Q9BXY8 128 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 RAB22AQ9UL26 194 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ATMQ13315 3056 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 FAM166BA8MTA8 275 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 M0R135 149 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SYNGR3O43761 229 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 CRYGSP22914 178 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SLC6A9P48067 706 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 MEOX1P50221 254 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 QRFPP83859 136 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PLGLB1Q02325 96 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 VASH2Q86V25 355 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SPTSSAQ969W0 71 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF799Q96GE5 643 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 RNF170Q96K19 258 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 LYZL4Q96KX0 146 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 FOXB1Q99853 325 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 GPR35Q9HC97 309 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ING3Q9NXR8 418 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 USP24Q9UPU5 2620 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 C5orf63A6NC05 138 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ARGFXA6NJG6 315 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SGCEO43556 437 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PEX14O75381 377 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 DHRS3O75911 302 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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PDE4D-208ENST00000502484 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 PMPCAQ10713 525 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ECH1Q13011 328 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 UNC119Q13432 240 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 OR10K2Q6IF99 312 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 RAB12Q6IQ22 244 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF627Q7L945 461 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 NOXA1Q86UR1 476 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 MEIOBQ8N635 442 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 MED28Q9H204 178 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 EMC3Q9P0I2 261 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 RAXQ9Y2V3 346 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 V9GYS6 101 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDE4D-208ENST00000502484 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 CACNA1GO43497 2377 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDE4D-208ENST00000502484 PRAF2O60831 178 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 LPLP06858 475 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 YES1P07947 543 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 DBHP09172 617 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 VSIG8P0DPA2 414 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 B4GALT1P15291 398 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 CD46P15529 392 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 STOMP27105 288 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 THBS4P35443 961 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ACTBP60709 375 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-208ENST00000502484 ACTG1P63261 375 aa7.18□□□□□ -1.26
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