RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 PCOLCEQ15113 449 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 ACTBL2Q562R1 376 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 DOK3Q7L591 496 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 BEST3Q8N1M1 668 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 OR4K17Q8NGC6 315 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 OR5B2Q96R09 309 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 SESN1Q9Y6P5 492 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 FAM186AA6NE01 2351 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 OR2F2O95006 317 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 OR2F1Q13607 317 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 AWAT2Q6E213 333 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 LIN54Q6MZP7 749 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 Q6ZSR3 168 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 KCNRGQ8N5I3 272 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 OR51E1Q8TCB6 317 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 GAL3ST1Q99999 423 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 LPAR5Q9H1C0 372 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 ZNF224Q9NZL3 707 aa22.15■■□□□ 1.14
ROM1-201ENST00000278833 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 YKT6O15498 198 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SIGLEC6O43699 453 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF43P17038 809 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CXADRP78310 365 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 C10orf128Q5T292 105 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 LCN10Q6JVE6 187 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OR4S1Q8NGB4 309 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 IFT46Q9NQC8 304 aa22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF292O60281 2723 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 A8MXK9 166 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SSX5O60225 188 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 STK17BO94768 372 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 FCER2P06734 321 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TAS2R31P59538 309 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SPEM2Q0P670 501 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ANGPTL5Q86XS5 388 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CCDC54Q8NEL0 328 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 KCNG3Q8TAE7 436 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SLC25A32Q9H2D1 315 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PFDN2Q9UHV9 154 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TNFSF18Q9UNG2 199 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 A0A1W2PNR3 127 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OR5H14A6NHG9 310 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CFIP05156 583 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CD96P40200 585 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ALDH3B1P43353 468 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 H3F3AP84243 136 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 IL11RAQ14626 422 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 VAX1Q5SQQ9 334 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TMPPEQ6ZT21 453 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 NAA40Q86UY6 237 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CHST4Q8NCG5 386 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TCEAL3Q969E4 200 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CMBLQ96DG6 245 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SEC61A2Q9H9S3 476 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 C9orf170A2RU37 121 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 KRBOX1C9JBD0 128 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 FGF2P09038 288 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 MFAP5Q13361 173 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TAF13Q15543 124 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 C11orf87Q6NUJ2 197 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ALKAL2Q6UX46 152 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 NKD1Q969G9 470 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CST11Q9H112 138 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 GPR84Q9NQS5 396 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ASH2LQ9UBL3 628 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 GHRLQ9UBU3 117 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.12■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF726A6NNF4 738 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 QDPRP09417 244 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PRF1P14222 555 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF17P17021 662 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CX3CR1P49238 355 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF546Q86UE3 836 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TMEM54Q969K7 222 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CXorf58Q96LI9 332 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 A0A1B0GW55 424 aa22.11■■□□□ 1.13
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