RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561212.5

ZEB1-222, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 5

Gene ZEB1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-222	ENST00000561212	GDNF	P39905	211 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	CAPZA1	P52907	286 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	RRAD	P55042	308 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	RAC1	P63000	192 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	CAMK2D	Q13557	499 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OR1C1	Q15619	314 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ODF4	Q2M2E3	257 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ZFP69	Q49AA0	526 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	XP32	Q5T750	250 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	RAET1L	Q5VY80	246 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	LINGO2	Q7L985	606 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	KRT74	Q7RTS7	529 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	GGN	Q86UU5	652 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	SULF2	Q8IWU5	870 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OR2M7	Q8NG81	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	SCMH1	Q96GD3	660 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	NIPAL2	Q9H841	368 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	NEK6	Q9HC98	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212		A0A1W2PPL8	197 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF726	A6NNF4	738 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF878	C9JN71	531 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212		H0YC42	278 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	RAMP1	O60894	148 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	KRT33A	O76009	404 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	F10	P00742	488 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OPN1LW	P04000	364 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	SP1	P08047	785 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ITGA5	P08648	1049 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ACSM4	P0C7M7	580 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	GSTT2B	P0CG30	244 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	TNFSF10	P50591	281 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	RAB25	P57735	213 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	TAS2R20	P59543	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	C10orf128	Q5T292	105 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	CORO6	Q6QEF8	472 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	OR52I2	Q8NH67	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	TMEM54	Q969K7	222 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	CENPM	Q9NSP4	180 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	NUDT15	Q9NV35	164 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	GLTP	Q9NZD2	209 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	EMC3	Q9P0I2	261 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAJC13	O75165	2243 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	CACNA1A	O00555	2505 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZEB1-222	ENST00000561212	ATM	Q13315	3056 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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