RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 CAMK2BQ13554 666 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 CPN1P15169 458 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 EPHA4P54764 986 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 TCTN1Q2MV58 587 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 QDPRP09417 244 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 TBXA2RP21731 343 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF136P52737 540 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 PADI1Q9ULC6 663 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 MYO7AQ13402 2215 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 SSR4P51571 173 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 MPPED2Q15777 294 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 A0A1B0GTH9 108 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 CD80P33681 288 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 FGF14Q92915 247 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF141Q15928 474 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 NAT6Q93015 286 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 MVB12AQ96EY5 273 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 SCMH1Q96GD3 660 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 OR51B6Q9H340 312 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 G3V3Y1 287 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 MSR1P21757 451 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 LINC00862A6NCI5 91 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 HMSDA8MTL9 139 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 CBX7O95931 251 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 GFERP55789 205 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 IKZF1Q13422 519 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 PRSS53Q2L4Q9 553 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 TSPAN32Q96QS1 320 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 DUSP2Q05923 314 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 BAMBIQ13145 260 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 C2orf50Q96LR7 162 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 LILRB5O75023 590 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 GPANK1O95872 356 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 RRASP10301 218 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 FCGR2CP31995 323 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 IFNA4P05014 189 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 AVPR2P30518 371 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 LFNGQ8NES3 379 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 RPL12P30050 165 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 UQCC3Q6UW78 93 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 Q6ZRG5 221 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 GPR173Q9NS66 373 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 HSPB6O14558 160 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 HPXP02790 462 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 LYPD8Q6UX82 237 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 PIGQQ9BRB3 760 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRU-202ENST00000373779 ST8SIA3O43173 380 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 NME2P1O60361 137 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 GREM1O60565 184 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 WNT11O96014 354 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 OR51A4Q8NGJ6 313 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 FANCFQ9NPI8 374 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 SIGLEC6O43699 453 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 OR13C7P0DN81 318 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 ENPP1P22413 925 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 SLC38A9Q8NBW4 561 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 SGK3Q96BR1 496 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 KCNJ15Q99712 375 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRU-202ENST00000373779 CTSFQ9UBX1 484 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.5 ms