RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 CFC1BP0CG36 223 aa4.59□□□□□ -1.67
MDM2-201ENST00000258148 CFC1P0CG37 223 aa4.59□□□□□ -1.67
MDM2-201ENST00000258148 RD3LP0DJH9 198 aa4.59□□□□□ -1.67
MDM2-201ENST00000258148 SNHG28P0DPA3 235 aa4.59□□□□□ -1.67
MDM2-201ENST00000258148 GFAPP14136 432 aa4.59□□□□□ -1.67
MDM2-201ENST00000258148 GLP1RP43220 463 aa4.59□□□□□ -1.67
MDM2-201ENST00000258148 FABP6P51161 128 aa4.59□□□□□ -1.67
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MDM2-201ENST00000258148 DLX1P56177 255 aa4.59□□□□□ -1.67
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MDM2-201ENST00000258148 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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MDM2-201ENST00000258148 CCDC144AA2RUR9 1427 aa4.59□□□□□ -1.67
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MDM2-201ENST00000258148 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa4.58□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 SHISA9B4DS77 424 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa4.58□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 AIFM1O95831 613 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 DNASE1L1P49184 302 aa4.58□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.58□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 LRRC45Q96CN5 670 aa4.58□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 TSG101Q99816 390 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 CALN1Q9BXU9 219 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 BEX2Q9BXY8 128 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 PSMD13Q9UNM6 376 aa4.58□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 GAKO14976 1311 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 SCN5AQ14524 2016 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 C1orf167Q5SNV9 1468 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 PXDNQ92626 1479 aa4.58□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 DLC1Q96QB1 1528 aa4.57□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.57□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 SGCEO43556 437 aa4.57□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 PGAM2P15259 253 aa4.57□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 NTSP30990 170 aa4.57□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 KDELR2P33947 212 aa4.57□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 HAAOP46952 286 aa4.57□□□□□ -1.68
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MDM2-201ENST00000258148 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 TWF1Q12792 350 aa4.57□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MDM2-201ENST00000258148 TPBGQ13641 420 aa4.57□□□□□ -1.68
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