RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTMS	P20962	102 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFSF4	P23510	183 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	VAMP1	P23763	118 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LAP3	P28838	519 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAA4	P35542	130 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	BMX	P51813	675 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAB21L1	Q13394	359 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL9	Q6T311	187 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNX32	Q86XE0	403 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC63	Q8NA47	563 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5J2	Q8NH18	312 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIFO	Q8TCI5	191 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFRSF14	Q92956	283 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAL2	Q969L2	176 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HAVCR1	Q96D42	359 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SSX3	Q99909	188 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB17	Q9H0T7	212 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDR91	A4D1P6	747 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	BTBD17	A6NE02	478 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RGS13	O14921	159 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF13	O43567	381 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM13	O60858	407 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	GYPA	P02724	150 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	THY1	P04216	161 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LYL1	P12980	280 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALDH3A1	P30838	453 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDH12	P55289	794 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLRN1	P58418	232 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NXN	Q6DKJ4	435 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HCP5	Q6MZN7	132 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPS33A	Q96AX1	596 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC115	Q96NT0	180 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR25	Q96S07	402 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDO	Q99489	341 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHID1	Q9BWS9	393 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDR76	Q9H967	626 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIAE	Q9HAT2	523 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0B4J2E0	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1B0GX12	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651		E9PQ18	207 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	DVL1	O14640	695 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LYPD3	O95274	346 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ABHD16A	O95870	558 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CH25H	O95992	272 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	DBH	P09172	617 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SELL	P14151	372 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB13	P51153	203 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	UFM1	P61960	85 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD83	Q01151	205 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	EMX2	Q04743	252 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR1Q1	Q15612	314 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C10orf128	Q5T292	105 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LCA5	Q86VQ0	697 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTOV1	Q86YD1	416 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASB10	Q8WXI3	467 aa		6.97	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms