RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 HMGN1P05114 100 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 GYPBP06028 91 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 HEXAP06865 529 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 DBHP09172 617 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 CLUP10909 449 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 SPI1P17947 270 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 COL8A2P25067 703 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 GIFP27352 417 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 POU1F1P28069 291 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 GCH1P30793 250 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 FMO3P31513 532 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 MPV17P39210 176 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 PSG7Q13046 419 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 WDR76Q9H967 626 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 TVP23AA6NH52 213 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 FAM183AA6NL82 134 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 PARP8Q8N3A8 854 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 COG8Q96MW5 612 aa7.19□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 TPK1Q9H3S4 243 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 JMJD1CQ15652 2540 aa7.19□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 CIB2O75838 187 aa7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 FCGR1AP12314 374 aa7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 ZNF3P17036 446 aa7.18□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.18□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.18□□□□□ -1.26
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PPARG-201ENST00000287820 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 ATF6BQ99941 703 aa7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 POFUT1Q9H488 388 aa7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 MED20Q9H944 212 aa7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 MARCH7Q9H992 704 aa7.18□□□□□ -1.26
PPARG-201ENST00000287820 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.18□□□□□ -1.26
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