RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	RER1	O15258	196 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PNP	P00491	289 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FSHB	P01225	129 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DBH	P09172	617 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TUBG1	P23258	451 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FPR3	P25089	353 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	LIPA	P38571	399 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ARHGDIA	P52565	204 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	MEP1B	Q16820	701 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	LIPN	Q5VXI9	398 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CCL17	Q92583	94 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB1C	Q92928	201 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PYURF	Q96I23	114 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM107B	Q9H098	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ADA2	Q9NZK5	511 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464		V9GYQ6	96 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464		J3QW42	95 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ARPC3	O15145	178 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GSTM3	P21266	225 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GSS	P48637	474 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS6KA3	P51812	740 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SPIB	Q01892	262 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ARL9	Q6T311	187 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	OR6V1	Q8N148	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FANK1	Q8TC84	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB39B	Q96DA2	213 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	OR52D1	Q9H346	318 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GADD45G	O95257	159 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ANPEP	P15144	967 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RAC2	P15153	192 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GYS2	P54840	703 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	COX10	Q12887	443 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RFX4	Q33E94	735 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CORO6	Q6QEF8	472 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CDRT15	Q96T59	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	NMNAT3	Q96T66	252 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GAL3ST1	Q99999	423 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RERGL	Q9H628	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	AURKC	Q9UQB9	309 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0G2JMP0	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0X1KG70	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464		J3QLI3	93 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	PSKH1	P11801	424 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V1B2	P21281	511 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRF-211	ENST00000467464	EPHA1	P21709	976 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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