RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 DTX3Q8N9I9 347 aa7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 GPR87Q9BY21 358 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 MMP28Q9H239 520 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 RNF121Q9H920 327 aa7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 MEIOCA2RUB1 952 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TTLL8A6PVC2 850 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 MAS1P04201 325 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ISG15P05161 165 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 DCTDP32321 178 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 MMP16P51512 607 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 GABREP78334 506 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 POU4F3Q15319 338 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 CYB561P49447 251 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CLDN12P56749 244 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-208ENST00000502484 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 BEST3Q8N1M1 668 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf198Q9H425 327 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.28□□□□□ -1.24
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