RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	NEFH	P12036	1026 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	AHCY	P23526	432 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHB	P35232	272 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIR2DS4	P43632	304 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	COPZ1	P61923	177 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERVK-25	P63136	954 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	HPCA	P84074	193 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSF2	Q03933	536 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CFAP157	Q5JU67	520 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	C10orf111	Q8N326	155 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCAI	Q8N9R8	606 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CMBL	Q96DG6	245 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	RHOV	Q96L33	236 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	TECTB	Q96PL2	329 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5M11	Q96RB7	305 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUX4	Q9UBX2	424 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651		H3BUX3	64 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	MLNR	O43193	412 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10H3	O60404	316 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLIN3	O60664	434 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC2A10	O95528	541 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PF4	P02776	101 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGA4	P0DJD7	388 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGA3	P0DJD8	388 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	NR2F1	P10589	423 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	UQCRB	P14927	111 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRPS1L1	P21108	318 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAFAH1B1	P43034	410 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLDN8	P56748	225 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAJB13	P59910	316 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CAV1	Q03135	178 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PUDP	Q08623	228 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC36A2	Q495M3	483 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	OTP	Q5XKR4	325 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIPK4	Q8NE63	616 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	MCHR2	Q969V1	340 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	NABP1	Q96AH0	204 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF607	Q96SK3	696 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL19	Q9UHD0	177 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	STARD10	Q9Y365	291 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A096LPI6	279 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHISA3	A0PJX4	238 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651		F5H5P2	479 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHYH	O14832	338 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPST2	O60704	377 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	HTR3B	O95264	441 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	AGR2	O95994	175 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCG5	P05408	212 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHRM2	P08172	466 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADORA3	P0DMS8	318 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	ETFA	P13804	333 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFRSF1A	P19438	455 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSMB10	P40306	273 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	MVD	P53602	400 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLP2	Q04941	152 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	FMOD	Q06828	376 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	CASP8	Q14790	479 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCLAF	Q15004	111 aa		7.02	□□□□□ -1.29

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