RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SBK2	P0C263	348 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FUT4	P22083	530 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ERF	P50548	548 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PSG7	Q13046	419 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	VMAC	Q2NL98	169 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	MTX3	Q5HYI7	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZR03	302 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM239	Q8WW34	195 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LIPH	Q8WWY8	451 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BSA7	217 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ANGPT2	O15123	496 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5F1	O95221	314 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	IGF2	P01344	180 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SCG5	P05408	212 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CST2	P09228	141 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A9	P48067	706 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R41	P59536	307 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	BTG1	P62324	171 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFA6	Q01524	100 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	BAMBI	Q13145	260 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	NFYC	Q13952	458 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF11	Q15544	211 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC80	Q76M96	950 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TREML1	Q86YW5	311 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SPIC	Q8N5J4	248 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	C4orf45	Q96LM5	186 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG12	Q9BV10	488 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PPL8	197 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338		H7C1C5	153 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FXYD1	O00168	92 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LIPA	P38571	399 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1E2	P47887	323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LCN6	P62502	163 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	PAX2	Q02962	417 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	FHL1	Q13642	323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG10	Q5BKT4	473 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	RABL3	Q5HYI8	236 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	EMC7	Q9NPA0	242 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-233	ENST00000602338	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-233	ENST00000602338	GMNC	A6NCL1	334 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-233	ENST00000602338	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN34	H7C241	214 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-233	ENST00000602338	FBP2	O00757	339 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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