RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 DYNLT1P63172 113 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 PLGLB1Q02325 96 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 RGS1Q08116 209 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 RAB35Q15286 201 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 CD226Q15762 336 aa4.57□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 NDUFA9Q16795 377 aa4.57□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 CNIH3Q8TBE1 160 aa4.57□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.57□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 IL26Q9NPH9 171 aa4.57□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 SPPL2AQ8TCT8 520 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa4.56□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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CCL20-201ENST00000358813 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.56□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 A0A087WW49 117 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 GABRR3A8MPY1 467 aa4.55□□□□□ -1.68
CCL20-201ENST00000358813 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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