RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034868.13

Clk1-201, Transcript of Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clk1, Length 1,796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1-201ENSMUST00000034868 Cd5P13379 494 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Rplp0P14869 317 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Nedd8P29595 81 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Cd69P37217 199 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 TgfaP48030 159 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Dnase2P56542 353 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 DsppP97399 934 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 MplQ08351 625 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Khdc4Q3TCX3 612 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Sel1l2Q3V172 688 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Cdh12Q5RJH3 794 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Nfatc2Q60591 927 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Dag1Q62165 893 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Phlda1Q62392 405 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Il11ra1Q64385 432 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Msrb2Q78J03 175 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr1106Q7TR57 312 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Znf770Q8BIQ8 705 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Zfp9Q8BIS1 454 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 TbckQ8BM85 762 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Arhgef33Q8BW86 850 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Gprin3Q8BWS5 763 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Zmat4Q8BZ94 229 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 FarsaQ8C0C7 508 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Q8C0X8 640 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Fbxl3Q8C4V4 428 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 BC106179Q8C9L1 186 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Phf13Q8K2W6 296 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Dedd2Q8QZV0 330 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Gtf2f2Q8R0A0 249 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Q8R3C1 574 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Nle1Q8VEJ4 485 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr183Q8VFB9 309 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr862Q8VFJ1 306 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 CytipQ91VY6 359 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 PglsQ9CQ60 257 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Tmem135Q9CYV5 458 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Upk1aQ9D132 257 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Fam3bQ9D309 235 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Gstt4Q9D4P7 240 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Q9D5Q8 446 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Phf10Q9D8M7 497 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Rnft1Q9DCN7 395 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Nudt22Q9DD16 308 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr926Q9EQ98 308 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Chrac1Q9JKP8 129 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Upk3aQ9JKX8 287 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Slc7a11Q9WTR6 502 aa4.64□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 FcmrA1KXC4 422 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Zfp981A2A8V7 445 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Zfp300A2AE21 645 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Ttll9A2APC3 461 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr74A2BHP6 318 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Gm12789B1AUV7 164 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Aadacl2B2RWD2 401 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr39E9PVX1 319 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Gpr137cE9Q343 423 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Kcng2F7A6P6 480 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Gm17654F7AXR3 209 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Adam3F8VQ03 822 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Fmo6J3QMN6 532 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Sult2b1O35400 338 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 GamtO35969 236 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Man2b2O54782 1018 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Psmb5O55234 264 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Kcnk4O88454 398 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 P01671 111 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Wnt4P22724 351 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Rab5cP35278 216 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Folr1P35846 255 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 LepP41160 167 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 SelenotP62342 195 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Cd80Q00609 306 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 ChatQ03059 641 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Treml2Q2LA85 329 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Tmem104Q3TB48 496 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 GmpsQ3THK7 693 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Fbxo39Q5NBU5 443 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr332Q5NC45 344 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Gng7Q61016 68 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Tfap2bQ61313 459 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 MyorgQ69ZQ1 716 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Mbtd1Q6P5G3 631 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 GnptgQ6S5C2 307 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Tdpoz5Q6YCH1 340 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Mtch1Q791T5 389 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr1299Q7TQX5 312 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Olfr1229Q7TQZ9 311 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Oxa1lQ8BGA9 433 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 Ap5m1Q8BJ63 490 aa4.63□□□□□ -1.67
Clk1-201ENSMUST00000034868 COA4Q8BT51 87 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 84.4 ms