Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Treml2Q2LA85 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Treml2Q2LA85 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Treml2Q2LA85 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Treml2Q2LA85 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Treml2Q2LA85 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Treml2Q2LA85 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Treml2Q2LA85 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Treml2Q2LA85 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Treml2Q2LA85 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Treml2Q2LA85 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Treml2Q2LA85 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Treml2Q2LA85 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Treml2Q2LA85 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Treml2Q2LA85 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Treml2Q2LA85 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Treml2Q2LA85 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Treml2Q2LA85 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Treml2Q2LA85 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Treml2Q2LA85 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Treml2Q2LA85 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Treml2Q2LA85 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Treml2Q2LA85 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Treml2Q2LA85 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Treml2Q2LA85 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Treml2Q2LA85 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Treml2Q2LA85 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Treml2Q2LA85 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Treml2Q2LA85 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Treml2Q2LA85 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Treml2Q2LA85 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Treml2Q2LA85 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Treml2Q2LA85 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Treml2Q2LA85 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Treml2Q2LA85 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Treml2Q2LA85 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Treml2Q2LA85 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Treml2Q2LA85 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Treml2Q2LA85 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Treml2Q2LA85 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Treml2Q2LA85 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Treml2Q2LA85 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Treml2Q2LA85 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Treml2Q2LA85 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Treml2Q2LA85 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Treml2Q2LA85 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Treml2Q2LA85 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Treml2Q2LA85 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Treml2Q2LA85 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Treml2Q2LA85 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Treml2Q2LA85 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Treml2Q2LA85 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Treml2Q2LA85 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Treml2Q2LA85 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Treml2Q2LA85 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Treml2Q2LA85 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Treml2Q2LA85 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Treml2Q2LA85 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Treml2Q2LA85 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Treml2Q2LA85 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Treml2Q2LA85 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Treml2Q2LA85 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Treml2Q2LA85 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Treml2Q2LA85 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Treml2Q2LA85 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Treml2Q2LA85 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Treml2Q2LA85 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Treml2Q2LA85 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Treml2Q2LA85 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Treml2Q2LA85 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Treml2Q2LA85 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Treml2Q2LA85 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Treml2Q2LA85 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Treml2Q2LA85 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Treml2Q2LA85 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Treml2Q2LA85 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Treml2Q2LA85 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Treml2Q2LA85 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Treml2Q2LA85 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Treml2Q2LA85 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Treml2Q2LA85 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Treml2Q2LA85 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Treml2Q2LA85 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Treml2Q2LA85 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Treml2Q2LA85 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Treml2Q2LA85 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Treml2Q2LA85 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Treml2Q2LA85 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Treml2Q2LA85 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Treml2Q2LA85 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Treml2Q2LA85 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Treml2Q2LA85 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Treml2Q2LA85 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Treml2Q2LA85 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Treml2Q2LA85 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Treml2Q2LA85 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Treml2Q2LA85 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Treml2Q2LA85 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Treml2Q2LA85 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Treml2Q2LA85 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms