Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Tfap2bQ61313 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Tfap2bQ61313 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tfap2bQ61313 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tfap2bQ61313 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tfap2bQ61313 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tfap2bQ61313 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Tfap2bQ61313 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Tfap2bQ61313 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tfap2bQ61313 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Tfap2bQ61313 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tfap2bQ61313 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Tfap2bQ61313 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Tfap2bQ61313 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tfap2bQ61313 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tfap2bQ61313 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Tfap2bQ61313 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tfap2bQ61313 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tfap2bQ61313 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tfap2bQ61313 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tfap2bQ61313 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tfap2bQ61313 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tfap2bQ61313 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tfap2bQ61313 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tfap2bQ61313 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tfap2bQ61313 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tfap2bQ61313 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Tfap2bQ61313 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Tfap2bQ61313 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tfap2bQ61313 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tfap2bQ61313 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tfap2bQ61313 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tfap2bQ61313 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tfap2bQ61313 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tfap2bQ61313 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tfap2bQ61313 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tfap2bQ61313 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tfap2bQ61313 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tfap2bQ61313 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tfap2bQ61313 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tfap2bQ61313 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Tfap2bQ61313 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tfap2bQ61313 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tfap2bQ61313 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tfap2bQ61313 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tfap2bQ61313 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tfap2bQ61313 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Tfap2bQ61313 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tfap2bQ61313 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tfap2bQ61313 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tfap2bQ61313 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tfap2bQ61313 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tfap2bQ61313 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tfap2bQ61313 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tfap2bQ61313 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tfap2bQ61313 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Tfap2bQ61313 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tfap2bQ61313 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tfap2bQ61313 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tfap2bQ61313 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tfap2bQ61313 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tfap2bQ61313 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tfap2bQ61313 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Tfap2bQ61313 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tfap2bQ61313 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tfap2bQ61313 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Tfap2bQ61313 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tfap2bQ61313 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tfap2bQ61313 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tfap2bQ61313 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tfap2bQ61313 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tfap2bQ61313 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Tfap2bQ61313 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tfap2bQ61313 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tfap2bQ61313 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tfap2bQ61313 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tfap2bQ61313 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tfap2bQ61313 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tfap2bQ61313 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tfap2bQ61313 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tfap2bQ61313 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tfap2bQ61313 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tfap2bQ61313 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tfap2bQ61313 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tfap2bQ61313 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tfap2bQ61313 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tfap2bQ61313 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tfap2bQ61313 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tfap2bQ61313 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tfap2bQ61313 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tfap2bQ61313 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tfap2bQ61313 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tfap2bQ61313 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tfap2bQ61313 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tfap2bQ61313 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tfap2bQ61313 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tfap2bQ61313 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tfap2bQ61313 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tfap2bQ61313 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tfap2bQ61313 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms