RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	HNT2	P49775	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
LAS1	YKR063C	IRC4	Q03036	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	ERO1	Q03103	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PLB2	Q03674	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	LCD1	Q04377	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PMD1	P32634	1753 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	FIG2	P25653	1609 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CDC34	P14682	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	SRM1	P21827	482 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	GRX7	P38068	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	SPL2	P38839	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	YFH7	P43591	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RSC1	P53236	928 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	TMA10	Q06177	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PPM2	Q08282	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
LAS1	YKR063C	COQ1	P18900	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	BAS1	P22035	811 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RFC5	P38251	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PIP2	P52960	996 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	GNT1	Q12096	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	SVS1	Q12254	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	GRX6	Q12438	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	GAL10	P04397	699 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CMP2	P14747	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	STE11	P23561	717 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RDS1	P25611	832 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	LYP1	P32487	611 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	LST4	P34239	828 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	DID4	P36108	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RKM3	P38222	552 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	PHO23	P50947	330 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	CBP3	P21560	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MIC60	P36112	540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	MAL33	P38157	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RTS1	P38903	757 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	EPL1	P43572	832 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	ALG2	P43636	503 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	TYW3	P53177	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	RSM24	Q03976	319 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	HKR1	P41809	1802 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAS1	YKR063C	INO1	P11986	533 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CDC20	P26309	610 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	APL1	P27351	700 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	ANP1	P32629	500 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	ERT1	P38140	529 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CTT1	P06115	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MBR1	P23493	339 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MAL31	P38156	614 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PNT1	P38969	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	TFC6	Q06339	672 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	ESC2	Q06340	456 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
LAS1	YKR063C	ACM1	Q08981	209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	BI4	P03879	638 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SNF3	P10870	884 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RIT1	P23796	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YKU70	P32807	602 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SLA2	P33338	968 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MNR2	P35724	969 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MYO3	P36006	1272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MNN4	P36044	1178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MRPL10	P36520	322 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.7 ms