RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	HMG1	P12683	1054 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	SFL1	P20134	766 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	CHS7	P38843	316 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	YNL193W	P53870	558 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	ORC4	P54791	529 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	ADR1	P07248	1323 aa		5	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	YBR259W	P38338	688 aa		5	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	ATG33	Q06485	197 aa		5	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	YLR001C	Q07895	862 aa		5	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	PPS1	P38148	807 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	YBR053C	P38235	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	MET13	P53128	600 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	DNM1	P54861	757 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	CTF4	Q01454	927 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	GAD1	Q04792	585 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	YIR042C	P40586	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	AMA1	P50082	593 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	MUK1	Q02866	612 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	ADY4	Q05955	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	IRC13	Q08630	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	YJR142W	P47173	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	HLJ1	P48353	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	PCL10	P53124	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	ARP4	P80428	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	GUD1	Q07729	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	YEL1	P34225	687 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	MNN4	P36044	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	YKR018C	P36114	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	YHR112C	P38716	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	YJL163C	P46996	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	MOH1	P38191	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	STB4	P50104	949 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	COG8	Q04632	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	APT2	P36973	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	BCD1	P38772	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	HOS4	P40480	1083 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	MTL1	P53214	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	COX18	P53239	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	OMS1	Q06668	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RSM27	YGR215W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	OAR1	P35731	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	ECM1	P39715	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	MGS1	P40151	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	UBA2	P52488	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	MCH5	Q08777	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	ACF2	Q12168	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	PCL5	P38794	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	YNL195C	P40168	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	DAS1	P47005	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	THI73	Q07904	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	APN2	P38207	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	FMO1	P38866	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	LYS9	P38999	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	UBC11	P52492	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	MCM21	Q06675	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	ECM3	Q99252	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RSM27	YGR215W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	BRN1	P38170	754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	TDA3	P38758	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	TIM44	Q01852	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	DCS2	Q12123	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	NUP145	P49687	1317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	HIR1	P32479	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YHL017W	P38745	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	SFB3	P38810	929 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RSM27	YGR215W	YHR202W	P38887	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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