RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	PES4	P39684	611 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	ZRG8	P40021	1076 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	ENA1	P13587	1091 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	YKU70	P32807	602 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	PBY1	P38254	753 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SHC1	P39000	512 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	CRF1	Q04930	467 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	TPO1	Q07824	586 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MDM38	Q08179	573 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	RIM20	Q12033	661 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	YLL058W	Q12198	575 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	HKR1	P41809	1802 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	STE11	P23561	717 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	AGP1	P25376	633 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.28	□□□□□ -1.56	not detected
CPR4	YCR069W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	BRN1	P38170	754 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	POA1	P38218	177 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MBP1	P39678	833 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	MRPS35	P53292	345 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	TAH18	Q12181	623 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CPR4	YCR069W	GIC1	P38785	314 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	IRC8	P47046	822 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	YNL193W	P53870	558 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	ADY3	Q07732	790 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	FUN30	P31380	1131 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SPL2	P38839	148 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	YFH7	P43591	353 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	MET12	P46151	657 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	OPI10	Q08202	246 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PSK2	Q08217	1101 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PMD1	P32634	1753 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	HIS5	P07172	385 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PRI2	P20457	528 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	HCM1	P25364	564 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SRP101	P32916	621 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	VBA5	P36172	582 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	OPY1	P38271	328 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.25	□□□□□ -1.57	not detected
CPR4	YCR069W	PLB1	P39105	664 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	YGR012W	P53206	393 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	IRC4	Q03036	179 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	CDA1	Q06702	301 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	MSM1	P22438	575 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	TRM2	P33753	639 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	YKL069W	P36088	180 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	NPP2	P39997	493 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	ALG2	P43636	503 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	EAF6	P47128	113 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PIP2	P52960	996 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	KIN4	Q01919	800 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PCT1	P13259	424 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PEP3	P27801	918 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	YHL017W	P38745	532 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	RTS1	P38903	757 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SHE9	Q04172	456 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	INM2	Q05533	292 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SPE1	P08432	466 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SNF3	P10870	884 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	VAC8	P39968	578 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PHO23	P50947	330 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	SFB2	P53953	876 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	NTO1	Q12311	748 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	LAM4	P38800	1345 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPR4	YCR069W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CPR4	YCR069W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58

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