RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	SYK	P43405	635 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SPA17	Q15506	151 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CBX1	P83916	185 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CYP7A1	P22680	504 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP7B	P35670	1465 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	HOXB7	P09629	217 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC27A2	O14975	620 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CPA1	P15085	419 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	RTN1	Q16799	776 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	YEATS4	O95619	227 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TYRO3	Q06418	890 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	GSTO1	P78417	241 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TAF4B	Q92750	862 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.08	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SIRT1	Q96EB6	747 aa		13.08	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	BAG3	O95817	575 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023		H0YHG0	523 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	SYT1	P21579	422 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	ESR2	Q92731	530 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	UBASH3A	P57075	661 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AKAP9-216	ENST00000619023	AMPD3	Q01432	767 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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