RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 KLK14Q9P0G3 267 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ERVK-7P63135 1459 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 TNRQ92752 1358 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 H3BRB1 525 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ICMTO60725 284 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 ABTB2Q8N961 1025 aa7.23□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 UNC13BO14795 1591 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 TNFRSF10BO14763 440 aa7.22□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 FAM13AO94988 1023 aa7.22□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 ITGA6P23229 1130 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 GMCL1Q96IK5 515 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF8-211ENST00000574728 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.22□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 PTPRTO14522 1441 aa7.21□□□□□ -1.25
PRPF8-211ENST00000574728 PPFIA3O75145 1194 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 IER5Q5VY09 327 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF787Q6DD87 383 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 CEP152O94986 1710 aa7.21□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 SYNMO15061 1565 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 NLRP1Q9C000 1473 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 NPR3P17342 541 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 MPSTP25325 297 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 HFM1A2PYH4 1435 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ITGAEP38570 1179 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.18□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.18□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.18□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 MED14O60244 1454 aa7.17□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 CDC14CA4D256 554 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.17□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 EPB42P16452 691 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 LTKP29376 864 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ARSDP51689 593 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 TYRO3Q06418 890 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 FAM26DQ5JW98 314 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 SV2AQ7L0J3 742 aa7.16□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 NUP155O75694 1391 aa7.16□□□□□ -1.26
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