RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.9□□□□□ -1.3
RRN3-204ENST00000561685 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.9□□□□□ -1.3
RRN3-204ENST00000561685 SLAIN2Q9P270 581 aa6.9□□□□□ -1.3
RRN3-204ENST00000561685 J3QW42 95 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 DYRK3O43781 588 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 GPR152Q8TDT2 470 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 MUC3BQ9H195 1237 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 HYAL2Q12891 473 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 HELQQ8TDG4 1101 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 SPACA7Q96KW9 195 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 SEPT3Q9UH03 358 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 ITGB7P26010 798 aa6.87□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 DLL1O00548 723 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB39O15060 712 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 KIF4AO95239 1232 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 PCSK2P16519 638 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 SCNN1AP37088 669 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 MTMR7Q9Y216 660 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 SSFA2P28290 1259 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 XKR5Q6UX68 686 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 Q8N3U1 123 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 TP53INP1Q96A56 240 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 ELP3Q9H9T3 547 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 PPME1Q9Y570 386 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3-204ENST00000561685 SETDB1Q15047 1291 aa6.83□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 XP32Q5T750 250 aa6.83□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.83□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 TTC16Q8NEE8 873 aa6.83□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 NOS3P29474 1203 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 CEP135Q66GS9 1140 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 C14orf37Q86TY3 774 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 ATCAYQ86WG3 371 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 EDEM1Q92611 657 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.82□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 FAM177BA6PVY3 158 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 MPSTP25325 297 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 CDC27P30260 824 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 ATP11AP98196 1134 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 PBX4Q9BYU1 374 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 PDGFAP04085 211 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 NPR3P17342 541 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 CEP120Q8N960 986 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 PMEPA1Q969W9 287 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 F8W735 103 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 FAM13AO94988 1023 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 PTPRAP18433 802 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 USP5P45974 858 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 EHHADHQ08426 723 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 C8orf34Q49A92 452 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 USTQ9Y2C2 406 aa6.79□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 CES1P23141 567 aa6.78□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZS46 218 aa6.78□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.78□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 ADAM19Q9H013 955 aa6.78□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 CNTN3Q9P232 1028 aa6.78□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.78□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.78□□□□□ -1.32
RRN3-204ENST00000561685 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.77□□□□□ -1.33
RRN3-204ENST00000561685 LINC01387J3KSC0 135 aa6.77□□□□□ -1.33
RRN3-204ENST00000561685 CABP4P57796 275 aa6.77□□□□□ -1.33
RRN3-204ENST00000561685 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.77□□□□□ -1.33
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