RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, human

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIPC-208	ENST00000557115	PSMD14	O00487	310 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	ECE2	O60344	883 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	COL4A1	P02462	1669 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CIPC-208	ENST00000557115	VAMP4	O75379	141 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	VEGFB	P49765	207 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	TRAF5	O00463	557 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.75	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	DPF2	Q92785	391 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	PCNT	O95613	3336 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	XDH	P47989	1333 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115		H7C1W4	665 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	GCKR	Q14397	625 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	GREM2	Q9H772	168 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CIPC-208	ENST00000557115	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	LINS1	Q8NG48	757 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	CST9	Q5W186	159 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	RTL9	Q8NET4	1388 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	GRM1	Q13255	1194 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	TNS4	Q8IZW8	715 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115		F6X3S4	739 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	ITGA6	P23229	1130 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	ECE1	P42892	770 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CIPC-208	ENST00000557115	FOXN1	O15353	648 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	CASP7	P55210	303 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	EGFR	P00533	1210 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	CSF1R	P07333	972 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	BEND3	Q5T5X7	828 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CIPC-208	ENST00000557115	KCNJ4	P48050	445 aa		27.57	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		27.57	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.57	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	MYH3	P11055	1940 aa		27.57	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.56	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.56	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	CACNA1F	O60840	1977 aa		27.56	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.55	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.55	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.55	■■■□□ 2
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		27.54	■■■□□ 2

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