RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
CS-231ENST00000552222 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CS-231ENST00000552222 SCARF1Q14162 830 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-231ENST00000552222 PARP10Q53GL7 1025 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-231ENST00000552222 NLRP10Q86W26 655 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-231ENST00000552222 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-231ENST00000552222 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-231ENST00000552222 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 SCN9AQ15858 1988 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 FZD1Q9UP38 647 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 COPS6Q7L5N1 327 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 MRS2Q9HD23 443 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 PRKG1Q13976 671 aa18.05■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.05■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 GCC1Q96CN9 775 aa18.05■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.04■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.04■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 VIL1P09327 827 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.04■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 MXD3Q9BW11 206 aa18.04■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 CAP1Q01518 475 aa18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 FAM89AQ96GI7 184 aa18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 ADAMTS8Q9UP79 889 aa18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 HTTP42858 3142 aa18.03■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 FKTNO75072 461 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 KRT24Q2M2I5 525 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 MIER1Q8N108 512 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.02■□□□□ 0.48
CS-231ENST00000552222 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.02■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 TM4SF4P48230 202 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 TCIRG1Q13488 830 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 TRIM17Q9Y577 477 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 CCER2I3L3R5 266 aa18■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.99■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 CENPFP49454 3210 aa17.99■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 BRCA2P51587 3418 aa17.99■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 UFL1O94874 794 aa17.98■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.98■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 GMLQ99445 158 aa17.98■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.98■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 ERBB4Q15303 1308 aa17.97■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 NEFMP07197 916 aa17.96■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 FKBP1BP68106 108 aa17.96■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 EYA3Q99504 573 aa17.96■□□□□ 0.47
CS-231ENST00000552222 SZT2Q5T011 3432 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 G3V3G9 751 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 USP17L8P0C7I0 530 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 NFE2L2Q16236 605 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 DCAF8Q5TAQ9 597 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 RUNDC1Q96C34 613 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.95■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 SASH1O94885 1247 aa17.94■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 RPS8P62241 208 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 TMC4Q7Z404 712 aa17.94■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.94■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.94■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa17.93■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.93■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 SPRYD7Q5W111 196 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 AGBL3Q8NEM8 1001 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 ISCA1Q9BUE6 129 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.92■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 FBXW7Q969H0 707 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 GGA1Q9UJY5 639 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.91■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 H0YGN5 161 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 WNT10BO00744 389 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
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