RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.24■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 JDP2Q8WYK2 163 aa21.24■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 MYD88Q99836 296 aa21.24■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.24■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.23■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 CRY2Q49AN0 593 aa21.23■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.23■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 PARP10Q53GL7 1025 aa21.22■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.22■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.22■□□□□ 0.99
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PACS1-208ENST00000529677 NLRP10Q86W26 655 aa21.21■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.21■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.21■□□□□ 0.99
PACS1-208ENST00000529677 FAM177BA6PVY3 158 aa21.2■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 ALDH1B1P30837 517 aa21.2■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 DLK2Q6UY11 383 aa21.2■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.2■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 LAMB2P55268 1798 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 GCKRQ14397 625 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 UTYO14607 1347 aa21.19■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.18■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.18■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 COG6Q9Y2V7 657 aa21.18■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 GPTP24298 496 aa21.17■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.17■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 NTSR2O95665 410 aa21.16■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 USP44Q9H0E7 712 aa21.16■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 H7C1W4 665 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 GRM8O00222 908 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 CASP7P55210 303 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 NOGQ13253 232 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 SUSD4Q5VX71 490 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 CRBNQ96SW2 442 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.15■□□□□ 0.98
PACS1-208ENST00000529677 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.14■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 SHTN1A0MZ66 631 aa21.14■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 CXCL9Q07325 125 aa21.14■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.14■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.14■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
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PACS1-208ENST00000529677 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 MEIS3Q99687 375 aa21.13■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 GNAI3P08754 354 aa21.12■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 AAMPQ13685 434 aa21.12■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 AOC3Q16853 763 aa21.12■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 NYXQ9GZU5 481 aa21.12■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.12■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 NIM1KQ8IY84 436 aa21.11■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.11■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.11■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.1■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 HUNKP57058 714 aa21.1■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 RNF186Q9NXI6 227 aa21.1■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 PPIP5K2O43314 1243 aa21.09■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.09■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.09■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.09■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.09■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 MYH3P11055 1940 aa21.09■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 NEFLP07196 543 aa21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 FAM89AQ96GI7 184 aa21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.08■□□□□ 0.97
PACS1-208ENST00000529677 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 TRPA1O75762 1119 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 KAZALD1Q96I82 304 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.07■□□□□ 0.96
PACS1-208ENST00000529677 RGMBQ6NW40 437 aa21.06■□□□□ 0.96
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