RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 ECE2O60344 883 aa36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 DOK7Q18PE1 504 aa36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 GGA1Q9UJY5 639 aa36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 UFL1O94874 794 aa36.36■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 DNAAF4Q8WXU2 420 aa36.36■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 MYH16Q9H6N6 1097 aa36.36■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 GCKRQ14397 625 aa36.35■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa36.35■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 DPF2Q92785 391 aa36.35■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 H7C1D1 291 aa36.34■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 KCNQ5Q9NR82 932 aa36.34■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 PGAP2Q9UHJ9 254 aa36.34■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 VEGFBP49765 207 aa36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 DEFB115Q30KQ5 88 aa36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 GREM2Q9H772 168 aa36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 MYH3P11055 1940 aa36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-209ENST00000479976 RASSF10A6NK89 507 aa36.32■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 MICALL2Q8IY33 904 aa36.32■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 LINS1Q8NG48 757 aa36.32■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 XDHP47989 1333 aa36.32■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 RTL9Q8NET4 1388 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 SHTN1A0MZ66 631 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 G3V3G9 751 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 TRAF5O00463 557 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 DCAF8Q5TAQ9 597 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 TRPM4Q8TD43 1214 aa36.3■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 PLA2G12BQ9BX93 195 aa36.3■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 RPS12P25398 132 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 ATP2B4P23634 1241 aa36.28■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 CST9Q5W186 159 aa36.28■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 CASP7P55210 303 aa36.27■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 MINPP1Q9UNW1 487 aa36.27■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 TRPM7Q96QT4 1865 aa36.26■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 VIL1P09327 827 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
CHTF18-209ENST00000479976 SAMD7Q7Z3H4 446 aa36.25■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 SCN9AQ15858 1988 aa36.24■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 F6X3S4 739 aa36.23■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 CSF1RP07333 972 aa36.23■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 CDC37L1Q7L3B6 337 aa36.23■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF521Q96K83 1311 aa36.22■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 ITGA6P23229 1130 aa36.21■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 BEND3Q5T5X7 828 aa36.21■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CHTF18-209ENST00000479976 SPEF2Q9C093 1822 aa36.2■■■■□ 3.38
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CHTF18-209ENST00000479976 CCT4P50991 539 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 PODNQ7Z5L7 613 aa36.19■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 TLL2Q9Y6L7 1015 aa36.19■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 EGFRP00533 1210 aa36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 FAM161AQ3B820 660 aa36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 AGBL3Q8NEM8 1001 aa36.16■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 MPHOSPH8Q99549 860 aa36.16■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 MED23Q9ULK4 1368 aa36.15■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 USP48Q86UV5 1035 aa36.15■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 WBP1LQ9NX94 342 aa36.15■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 LEMD3Q9Y2U8 911 aa36.15■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 FOXN1O15353 648 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 ECE1P42892 770 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 AIDAQ96BJ3 306 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 CAPNS2Q96L46 248 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 ANKRD2Q9GZV1 360 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF18-209ENST00000479976 USP17L3A6NCW0 530 aa36.13■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 USP17L4A6NCW7 530 aa36.13■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 FOXO4P98177 505 aa36.13■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 USP17L1Q7RTZ2 530 aa36.13■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 SAPCD2Q86UD0 394 aa36.13■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF609O15014 1411 aa36.12■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa36.12■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa36.12■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 CYP4F22Q6NT55 531 aa36.12■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF408Q9H9D4 720 aa36.12■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 PSME4Q14997 1843 aa36.12■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 KRT26Q7Z3Y9 468 aa36.11■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 TNS4Q8IZW8 715 aa36.11■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 GMLQ99445 158 aa36.11■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 GRM8O00222 908 aa36.09■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF804BA4D1E1 1349 aa36.08■■■■□ 3.37
CHTF18-209ENST00000479976 GRM1Q13255 1194 aa36.08■■■■□ 3.37
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