RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451997.5

SH3BP1-203, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 3,123 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-203ENST00000451997 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP1-203ENST00000451997 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP1-203ENST00000451997 MYL6BP14649 208 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP1-203ENST00000451997 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP1-203ENST00000451997 KINO60870 393 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP1-203ENST00000451997 STX1AQ16623 288 aa14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP1-203ENST00000451997 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP1-203ENST00000451997 USP31Q70CQ4 1352 aa14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP1-203ENST00000451997 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP1-203ENST00000451997 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP1-203ENST00000451997 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP1-203ENST00000451997 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP1-203ENST00000451997 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP1-203ENST00000451997 HAND2P61296 217 aa14.71□□□□□ -0.05
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SH3BP1-203ENST00000451997 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.71□□□□□ -0.05
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